معرفی شرکت ها
avidaq-0.0.5
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
controls for napari and micromanger
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | OS Independent |
| نام فایل | avidaq-0.0.5 |
| نام | avidaq |
| نسخه کتابخانه | 0.0.5 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | Riley M Shea |
| ایمیل نویسنده | RileyMShea@gmail.com |
| آدرس صفحه اصلی | - |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/avidaq/ |
| مجوز | BSD-3-Clause |
# avidaq
[](https://pypi.org/project/avidaq)
[](https://python.org)
[](https://github.com/optimax/avidaq/actions)
[](https://codecov.io/gh/optimax/avidaq)
[](https://napari-hub.org/plugins/avidaq)
controls for napari and micromanger
---
This [napari] plugin was generated with [Cookiecutter] using [@napari]'s [cookiecutter-napari-plugin] template.
<!--
Don't miss the full getting started guide to set up your new package:
https://github.com/napari/cookiecutter-napari-plugin#getting-started
and review the napari docs for plugin developers:
https://napari.org/plugins/index.html
-->
## Installation
### Standard installation
You can install `avidaq` via [pip]:
```shell
pip install napari[all] avidaq
```
### Install from plugin menu
Alternatively you can install `avidaq` via the [napari] plugin menu:
## 
## Running
First start micromanager. Make sure the server port checkbox is activated.
Then to start napari with the avidaq plugin active run:
`napari -w avidaq`
## Updating presets
MDA presets are stored in a json file in the user's home directory.
```shell
`C:\\Users\YourName\.avidaq\mda_presets.json`
```
This file should exist after plugin installation with some defaults. You do not need to create the file yourself.
Add or modify the values and reload napari to see the changes.
All parameter entries are optional, if not provided the default value will be used.
The parameter names and their descriptions can be found [here] (https://github.com/micro-manager/pycro-manager/blob/main/pycromanager/acq_util.py#L102-L115)
The format is as follows:
```json
{
"gui_display_name": {
"parameter_name": value,
"parameter_name": value,
...
},
"gui_display_name": {
"parameter_name": value,
"parameter_name": value,
...
},
...
}
```
defaults:
```json
{
"Basic": {
"num_time_points": 5,
"z_start": 0,
"z_end": 6,
"z_step": 0.4
},
"Simple": {
"num_time_points": 2,
"z_start": 0,
"z_end": 2,
"z_step": 0.1
},
"Detailed": {
"num_time_points": 10,
"z_start": 0,
"z_end": 12,
"z_step": 0.2
}
}
```
## Issues
If you encounter any problems, please [file an issue] along with a detailed description.
## Development
You should have python3.8 or higher installed.
1. clone this repo
2. create a virtual environment `python -m venv .venv && source .venv/bin/activate`
3. run `pip install -e '.[testing,build]'`
4. run `pre-commit install`
### To run unit tests
`pytest`
### typical workflow
1. edit code in `/src`
2. run napari -w avidaq
3. repeat
### Releasing to pypi
Project is automically built and deployed to pypi upon
---
[napari]: https://github.com/napari/napari
[cookiecutter]: https://github.com/audreyr/cookiecutter
[@napari]: https://github.com/napari
[mit]: http://opensource.org/licenses/MIT
[bsd-3]: http://opensource.org/licenses/BSD-3-Clause
[gnu gpl v3.0]: http://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.txt
[gnu lgpl v3.0]: http://www.gnu.org/licenses/lgpl-3.0.txt
[apache software license 2.0]: http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
[mozilla public license 2.0]: https://www.mozilla.org/media/MPL/2.0/index.txt
[cookiecutter-napari-plugin]: https://github.com/napari/cookiecutter-napari-plugin
[napari]: https://github.com/napari/napari
[tox]: https://tox.readthedocs.io/en/latest/
[pip]: https://pypi.org/project/pip/
[pypi]: https://pypi.org/
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | magicgui |
| - | numpy |
| - | pycromanager |
| - | qtpy |
| - | twine |
| - | black |
| - | ipykernel |
| - | matplotlib |
| - | napari |
| - | pyqt5 |
| - | pyright |
| - | pytest |
| - | pytest-cov |
| - | pytest-qt |
| - | tox |
| - | yappi |
زبان مورد نیاز
| مقدار | نام |
|---|---|
| >=3.8 | Python |
نحوه نصب
نصب پکیج whl avidaq-0.0.5:
pip install avidaq-0.0.5.whl
نصب پکیج tar.gz avidaq-0.0.5:
pip install avidaq-0.0.5.tar.gz