معرفی شرکت ها


ftir-renamer-0.9


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

File renamer for FTIR files
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل ftir-renamer-0.9
نام ftir-renamer
نسخه کتابخانه 0.9
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Adam Koziol
ایمیل نویسنده adam.koziol@canada.ca
آدرس صفحه اصلی https://github.com/adamkoziol/ftir_renamer.git
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/ftir-renamer/
مجوز MIT
FTIR File Renamer ============== ### Introduction Renames files from the FTIR based on strict naming scheme ### Virtual Environment Activate your FTIR renamer virtual environment `source ftir_rename/bin/activate` If that does not work, your environment may not exist. Create it as follows: ``` python3 -m venv ftir_rename source ftir_rename/bin/activate ``` ### Installation From the command line in the folder in which you would like to install the program: `pip install ftir_renamer` ### Upgrade `pip install --upgrade ftir_renamer` ### Requirements - Unix-like environment - Spreadsheet of FTIR-related metadata (with .XLSX extension) - The .spc output files corresponding to the FTIR IDs in the spreadsheet ## ftir_rename Shell script automating the renaming of files from a USB stick ### Required Argument ``` -f The absolute path to the folder containing the .spc files. Note that either this folder or its parent must contain an Excel file named FTIR.XLSX that contains all the required metadata for renaming. ``` ### Optional Argument ``` -c Use the "classic method of renaming the files: Original File Name: FTIR0182-1_2017-05-26T11-13-47.spc New File Name: GN_Klebsiella_BHI_AN_CFIA_FTIR0182_C2_2017_May_26_CA01_OLC0027_2017-05-26T11-13-47.spc ``` ### Running ##### Example command to run the script `ftir_rename -f /path/to/FTIR_files` ## renamer.py Python script that renames .spc files ### Required Arguments ``` -s The path of the folder containing the FTIR output files -f Absolute path to the spreadsheet containing the FTIR metadata -o The absolute path of the folder to store the renamed files ``` ### Running ##### Example command to run the script `renamer.py -f /path/to/FTIR.xlsx -s /path/to/files -o /path/to/outputs` ##### Usage ``` usage: renamer.py [-h] -s SPECTRA_PATH -f FILENAME -o OUTPUTPATH Rename files for FTIR experiments using strict naming scheme -h, --help show this help message and exit required arguments: -s SPECTRA_PATH, --sequencepath SPECTRA_PATH Path of .spc files to process. -f FILENAME, --filename FILENAME Name of .xls(x) file with renaming information. Must conform to agreed upon format. This file must be in the supplied sequencepath. -o OUTPUTPATH, --outputpath OUTPUTPATH Optionally specify the folder in which the renamed files are to be stored. Provide the full path e.g. /path/to/output/files ```


نحوه نصب


نصب پکیج whl ftir-renamer-0.9:

    pip install ftir-renamer-0.9.whl


نصب پکیج tar.gz ftir-renamer-0.9:

    pip install ftir-renamer-0.9.tar.gz