معرفی شرکت ها

fsleyes-plugin-mrs-0.0.8

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.0.8
0.0.7
0.0.6
0.0.5
0.0.8
0.0.7
0.0.6
0.0.5

توضیحات

FSLeyes extension for viewing MRS(I) data formatted as NIfTI-MRS.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل fsleyes-plugin-mrs-0.0.8
نام fsleyes-plugin-mrs
نسخه کتابخانه 0.0.8
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده William Clarke, University of Oxford
ایمیل نویسنده william.clarke@ndcn.ox.ac.uk
آدرس صفحه اصلی https://git.fmrib.ox.ac.uk/wclarke/fsleyes-plugin-mrs
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/fsleyes-plugin-mrs/
مجوز -
# fsleyes-plugin-mrs An [FSLeyes](https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FSLeyes) plugin for viewing the [NIfTI-MRS](https://github.com/wexeee/mrs_nifti_standard/) format. This plugin adds an additional MRS specific view panel to FSLeyes which displays spectra in the frequency domain. Higher dimensions of data stored in NIfTI-MRS format may be explored. This plugin also loads and displays results from FSL-MRS's mrsi fitting routine `fsl_mrsi`. The plugin displays the spectral fit for each voxel and creates an interface for loading output metabolite maps easily. ## Installation Relies on [FSLeyes](https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FSLeyes) (version >= 1.0.10). This package must be installed in the same environment as FSLeyes is run from. Install using conda, pip, or by cloning this repository. For full installation instructions please see the [documentation](https://open.win.ox.ac.uk/pages/wclarke/fsleyes-plugin-mrs/install.html). ### Conda After activating the target environment run conda install -c conda-forge fsleyes-plugin-mrs ### PyPI pip install fsleyes-plugin-mrs ### Cloning from git git clone https://git.fmrib.ox.ac.uk/wclarke/fsleyes-plugin-mrs cd fsleyes-plugin-mrs pip install . ## Quick start guide For full instructions please see the [documentation](https://open.win.ox.ac.uk/pages/wclarke/fsleyes-plugin-mrs/index.html). ### NIfTI-MRS viewer Start the dedicated MRSView by selecting `MRSView` in the `View` menu. Once open the NIfTI-MRS dimension selector can be opened by clicking the ![](fsleyes_plugin_mrs/icons/nifti_mrs_icon-mrs_icon_highlight_thumb24.png) icon. Alternatively, a built-in MRS layout can be loaded from the `View - Layouts` menu, or the command line using: fsleyes -smrs ... for example with data fsleyes -smrs t1.nii.gz svs.nii.gz ### MRSI results viewer A results folder generated by FSL-MRS's `fsl_mrsi` script can be loaded by using the `Tools - Load FSL-MRS fit` menu item. The spectral fit, baseline, and residual is displayed in the MRSView. Metabolite maps and QC metrics can be loaded using the `FSL-MRS Results` panel added to the bottom of the orthographic view. ## Acknowledgements and referencing If you use this tool in your research please cite: TBC Thanks to Paul McCarthy for his significant input into development of this plugin.


نیازمندی

مقدار نام
>=1.0.10 fsleyes


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.7 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl fsleyes-plugin-mrs-0.0.8:

    pip install fsleyes-plugin-mrs-0.0.8.whl


نصب پکیج tar.gz fsleyes-plugin-mrs-0.0.8:

    pip install fsleyes-plugin-mrs-0.0.8.tar.gz