معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

framed - metabolic modeling for python

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	framed-0.5.2
نام	framed
نسخه کتابخانه	0.5.2
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Daniel Machado
ایمیل نویسنده	cdanielmachado@gmail.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/cdanielmachado/framed
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/framed/
مجوز	Apache License Version 2.0

|DOI| |License| |PyPI version| |Documentation Status| FRAMED ====== *framed* is a python package for analysis and simulation of metabolic models. The main focus is to provide support for different modeling approaches. - Modeling: Constraint-based models, Kinetic models, Bioprocess models - I/O: Import/Export from SBML and other plain text formats (including BioOpt) - Solver support: Gurobi, CPLEX - COBRA tools: - Simulation: FBA, pFBA, loopless-FBA, MOMA, linearMOMA, ROOM - Gene-wise simulation: gene-pFBA, gene-MOMA, gene-lMOMA, gene-ROOM - Analysis: FVA, gene essentiality, PhPP, flux envelope plots - Ensemble-based simulation (and SBML import/export of ensemble models) - Omics integration: GIMME, E-Flux - Strain design: brute force, hill climbing - Kinetic tools: - Time-course and steady-state simulation - Steady-state flux sampling - Calibration from metabolomics data - Bioprocess modeling: - Dynamic FBA (single and multi-species) - Microbial community modeling: - SMETANA Documentation ~~~~~~~~~~~~~ For documentation and API please check: http://framed.readthedocs.io/ Instalation from PyPI (stable releases) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ :: pip install framed Instalation from github (latest development release) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ :: pip install https://github.com/cdanielmachado/framed/archive/master.zip Credits and License ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Developed at: - The Novo Nordisk Fundation Center for Biosustainability (2013) - Centre of Biological Engineering, University of Minho (2014-2015) - European Molecular Biology Laboratory (2016-2017) Released under an Apache License. .. |DOI| image:: https://zenodo.org/badge/DOI/10.5281/zenodo.240430.svg :target: https://doi.org/10.5281/zenodo.240430 .. |License| image:: https://img.shields.io/badge/License-Apache%202.0-blue.svg :target: https://opensource.org/licenses/Apache-2.0 .. |PyPI version| image:: https://badge.fury.io/py/framed.svg :target: https://badge.fury.io/py/framed .. |Documentation Status| image:: http://readthedocs.org/projects/framed/badge/?version=latest :target: http://framed.readthedocs.io/en/latest/?badge=latest

نیازمندی

مقدار	نام
-	numpy
-	scipy
-	sympy
-	python-libsbml
-	matplotlib
-	pandas

نحوه نصب

نصب پکیج whl framed-0.5.2:

pip install framed-0.5.2.whl

نصب پکیج tar.gz framed-0.5.2:

pip install framed-0.5.2.tar.gz