معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Several useful tools for manipulating FASTQ files.

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	fqutil-1.1
نام	fqutil
نسخه کتابخانه	1.1
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Jeff Stafford
ایمیل نویسنده	jeff.stafford@queensu.ca
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/jstaf/fqutil
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/fqutil/
مجوز	BSD-3

# fqutils A couple Python-based FASTQ QC tools that perform several useful file handling operations, notably check read-pairing, repair read-pairing, and trim reads. Notably, `fq-repair` is the only tool (to my knowledge) that can successfully re-pair reads from gzipped FASTQ input. All tools are designed to be as fast and memory-efficient as possible. Input is assumed to be 4-line FASTQ and may be gzipped. ## Installation and tests `fqutils` has no dependencies aside from the Python 3 standard library (if this Python is installed, things will work). Just clone the repository with with `git clone https://github.com/jstaf/fqutils.git`. Clever users will also note that this repository can be installed as a python package with `pip install .` To run tests: `pytest` ## Current scripts Run `commandname --help` for individual usage instructions. Sample commands can also be found in the `tests/` directory. * **fq-checkpair** - Check if two FASTQ files are properly paired and highlight errors. * **fq-trim** - Starting from both ends, trim a read so that bases below a certain Phred quality score are removed. Resulting reads shorter than a minimum length are removed. Fast, dirty, and idiot-proof trimming. * **fq-repair** - Re-pair the reads in two FASTQ files if reads have been filtered out or otherwise reordered. * **fq-zwc** - Just a wrapper around `wc -l` for gzipped files.

نحوه نصب

نصب پکیج whl fqutil-1.1:

pip install fqutil-1.1.whl

نصب پکیج tar.gz fqutil-1.1:

pip install fqutil-1.1.tar.gz