معرفی شرکت ها


flowmepy-0.2.16


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

a C++ FCS Loader
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل flowmepy-0.2.16
نام flowmepy
نسخه کتابخانه 0.2.16
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Markus Diem, Lisa Weijler, Matthias Woedlinger, Florian Kowarsch
ایمیل نویسنده lweijler@cvl.tuwien.ac.at
آدرس صفحه اصلی -
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/flowmepy/
مجوز -
# FlowMePy - a Python API for FlowMe Load FCS 2.0/3.0/3.1 files with super fast C++ code. The FCS processing includes compensation and logicle transform. If FacsDiva projects (XMLs) or Kaluza projects (analysis) are provided, the FlowMePy will label events according to the gates contained. [Read the Docs](https://kwc.pages.cvl.tuwien.ac.at/dev/flowme-python-api/) ## Install We provide a pre-compiled package (currently Windows only) which can be installed using: ````console pip install flowmepy ```` ### Dependencies - `python` (>= 3.6) - `CMake` (>= 3.14.1) - `Qt` SDK or the compiled sources (>= 5.11.0) - `OpenCV` (>= 4.0.0) - Visual Studio (>= 2015) or gcc ### Configure FlowMe using CMake (Windows only) - dir to ./flowme - copy `CMakeUserPathsGit.cmake` and rename it to `CMakeUserPaths.cmake` - add your library paths to the `${CMAKE_PREFIX_PATH}` in `CMakeUserPaths.cmake` ## Clone We use submodules for `flowme` and `pybind11` if you clone using ````console $ git clone --recursive git@smithers.cvl.tuwien.ac.at:kwc/dev/flowme-python-api.git ```` everything should be fine. In case the repository's `flowme` or `pybind11` folders are empty, check if the pull worked as expected: - don't forget `--recursive` - windows users: it's easiest if you do not password protect the ssh key ## Build ````console $ virtualenv env $ source /env/bin/activate $ python setup.py install ```` If anything did not work as expected, try building FlowMe as standalone package (see [README](./flowme/README.md)). Then run the above command again. You can remove old versions using pip: ````console $ pip uninstall FlowMePy Successfully uninstalled flowmepy-0.0.3 ```` ## Packaging FlowMePy Update pip (on Windows & Linux), then create the wheel: ````console python -m pip install --upgrade setuptools wheel python setup.py sdist bdist_wheel ```` where `sdist` creates the source archive (without C++ files) and bdist_wheel creates the build package. Then, upload the package: ````console python -m twine upload dist/* ```` in case you want to test your package, use this for uploading: ````console python -m twine upload --repository-url https://test.pypi.org/legacy/ dist/* ```` Unfortunately, test.pypi.org rejects linux binary wheels - so linux users must build packages on their own. You can install this package using: ````console pip install -i https://test.pypi.org/simple/ flowmepy --extra-index-url https://pypi.org/simple ```` ## Test Test flowmepy using: ````console $ python -m unittest discover -v test ```` ## build the docs ````console $ cd docs $ make html ```` The compiled docs are here: [`docs/_build/index.html`](docs/_build/index.html) ## FlowMePy in 2 minutes load an FCS using ````python import flowme filepath = "./flowme/src/data/samples/FacsDiva.xml" sample = flowme.fcs(filepath) events = sample.events() # get the event data (pandas.DataFrame) gates = sample.gate_labels() # get gating (GT) information (pandas.DataFrame) ```` Per default events are **not** filtered by any Gate. However, it is possible to pass the name of a filtering gate: ````python import flowme filepath = "./flowme/src/data/samples/FacsDiva.xml" filter_gatename = "viable" sample = flowme.fcs(filepath, filter_gatename) ```` ![mascot](https://upload.wikimedia.org/wikipedia/en/thumb/0/02/Tweety.svg/133px-Tweety.svg.png)


نیازمندی

مقدار نام
>=1.17.4 numpy
>=0.24.2 pandas
!=3.16.3 cmake


نحوه نصب


نصب پکیج whl flowmepy-0.2.16:

    pip install flowmepy-0.2.16.whl


نصب پکیج tar.gz flowmepy-0.2.16:

    pip install flowmepy-0.2.16.tar.gz