معرفی شرکت ها


flair-brookslab-1.7.0


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

flair
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل flair-brookslab-1.7.0
نام flair-brookslab
نسخه کتابخانه 1.7.0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Jeltje van Baren
ایمیل نویسنده jeltje.van.baren@gmail.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/BrooksLabUCSC/flair
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/flair-brookslab/
مجوز -
# flair FLAIR (Full-Length Alternative Isoform analysis of RNA) for the correction, isoform definition, and alternative splicing analysis of noisy reads. FLAIR has primarily been used for nanopore cDNA, native RNA, and PacBio sequencing reads. The complete Flair manual is available via [readthedocs](https://flair.readthedocs.io/en/latest/) ## Cite FLAIR <a name="cite"></a> If you use or discuss FLAIR, please cite the following [paper](https://www.nature.com/articles/s41467-020-15171-6): >Tang, A.D., Soulette, C.M., van Baren, M.J. et al. Full-length transcript characterization of SF3B1 mutation in chronic lymphocytic leukemia reveals downregulation of retained introns. Nat Commun 11, 1438 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-15171-6 COPYRIGHT 2019 THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF CALIFORNIA Disclosed to the UC Regents as Technology Number SC2020-258 Redistribution and use in source and binary forms, with or without modification, are permitted provided that the following conditions are met: 1. Redistributions of source code must retain the above copyright notice, this list of conditions and the following disclaimer. 2. Redistributions in binary form must reproduce the above copyright notice, this list of conditions and the following disclaimer in the documentation and/or other materials provided with the distribution. 3. Neither the name of the copyright holder nor the names of its contributors may be used to endorse or promote products derived from this software without specific prior written permission. THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE COPYRIGHT HOLDERS AND CONTRIBUTORS "AS IS" AND ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE ARE DISCLAIMED. IN NO EVENT SHALL THE COPYRIGHT HOLDER OR CONTRIBUTORS BE LIABLE FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS OR SERVICES; LOSS OF USE, DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION) HOWEVER CAUSED AND ON ANY THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.


نیازمندی

مقدار نام
- numpy
- tqdm
- ncls
- pybedtools
==2.24 mappy
- pysam
- scipy


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.6 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl flair-brookslab-1.7.0:

    pip install flair-brookslab-1.7.0.whl


نصب پکیج tar.gz flair-brookslab-1.7.0:

    pip install flair-brookslab-1.7.0.tar.gz