معرفی شرکت ها

findmycells-0.1.2

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.1.2
0.1.1
0.1.0
0.1.2
0.1.1
0.1.0

توضیحات

An end-to-end bioimage analysis pipeline with state-of-the-art tools for non-coding experts
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل findmycells-0.1.2
نام findmycells
نسخه کتابخانه 0.1.2
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده DSegebarth
ایمیل نویسنده d.segebarth@gmail.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/Defense-Circuits-Lab/findmycells
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/findmycells/
مجوز GNU General Public License v3
findmycells ================ <!-- WARNING: THIS FILE WAS AUTOGENERATED! DO NOT EDIT! --> # Hi there! <p> <img src="https://github.com/Defense-Circuits-Lab/findmycells/blob/main/media/findmycells_logo_low_res.png?raw=true" style="float:right;width:300px;"> <font size="3"> Over the past years, deep-learning-based tools have become increasingly popular and abundant, particularly in the image processing domain. In fact, even the image shown next to this text was created by such a tool - with nothing but a few keywords as input (go checkout <a href="https://starryai.com/">starryai</a>). Similarly, deep-learning-based image analysis tools also have a growing impact on biomedical research. However, such deep-learning-powered scientific software tools are rarely as user-friendly as starryai (or <a href="http://www.mackenziemathislab.org/deeplabcut">DeepLabCut</a>, to name at least one positive exception). And make no mistake, also <i>findmycells</i> will not be able to make such a giant leap forward. Instead, it was developed to narrow the gap by bringing state-of-the-art deep-learning-based bioimage analysis tools to users with little or even no coding experience. This is achieved, as it integrates them in a full end-to-end bioimage analysis pipeline that comes with an intuitive and interactive graphical user interface that runs directly in Jupyter Notebooks. But enough introduction - please feel free to test it yourself! Either follow the installation instructions below, or head over for instance to the <a href="https://defense-circuits-lab.github.io/findmycells/tutorials/gui_tutorial.html">GUI tutorial</a> to get a first impression! </font> </p> # Installation guide *findmycells* is currently only available via pip: > pip install findmycells **Note:** Please be aware that *findmycells* was so far only tested in a Linux subsystem run under Windows (Ubuntu 20.04.5 in WSL2 on both Windows 10 and Windows 11). In addition, having a GPU is highly recommended when using [deepflash2](https://github.com/matjesg/deepflash2) or [cellpose](https://github.com/MouseLand/cellpose) for the segmentation of your images. # For developers This package is developed using [nbdev](https://nbdev.fast.ai/)


نیازمندی

مقدار نام
>=1.8.0 shapely
==7.6.5 ipywidgets
- jupyterlab
==0.1.7 deepflash2
>=2.0.5 cellpose
- czifile
- roifile
- connected-components-3d
- ipyfilechooser
- wget
==1.0.2 jupyterlab-widgets
- nbdev


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.7 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl findmycells-0.1.2:

    pip install findmycells-0.1.2.whl


نصب پکیج tar.gz findmycells-0.1.2:

    pip install findmycells-0.1.2.tar.gz