معرفی شرکت ها
fhirbase-0.0.1
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
fhirbase connector
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | fhirbase-0.0.1 |
| نام | fhirbase |
| نسخه کتابخانه | 0.0.1 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | HealthSamurai |
| ایمیل نویسنده | fhirbase.py@health-samurai.io |
| آدرس صفحه اصلی | http://github.com/fhirbase/fhirbase.py |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/fhirbase/ |
| مجوز | - |
[](https://travis-ci.org/fhirbase/fhirbase.py)
[](https://pypi.python.org/pypi/fhirbase)
# fhirbase.py
FHIRBase connector for python.
This package provides wrapper over psycopg2 connection which
provides CRUD for resources in fhirbase.
# Install
```
pip install fhirbase
```
# Usage
Import `fhirbase` and `psycopg2` libraries:
```
import fhirbase
import psycopg2
```
Create a connection using `psycopg2.connect`;
```
connection = psycopg2.connect(
dbname='postgres', user='postgres',
host='localhost', port='5432')
```
Create an instance of `FHIRBase`:
```
fb = fhribase.FHIRBase(connection)
```
Now you can use the following methods of `FHIRBase` instance:
* `.execute(sql, params=None, commit=False)`
* `.execute_without_result(sql, params=None, commit=False)`
* `.row_to_resource(row)`
CRUD methods work with [FHIR resources](https://www.hl7.org/fhir/resourcelist.html).
Resource represented as a dict with specified `resourceType` key as required key.
The following methods works with resource and returns resources.
* `.create(resource, txid=None, commit=True)`
* `.update(resource, txid=None, commit=True)`
* `.delete(resource, txid=None, commit=True)`/`.delete(resource_type, id, txid=None, commit=True)`
* `.read(resource)`/`.read(resource_type, id)`
* `.list(sql, params=None)`
# Methods
### .execute
Executes sql with params.
Syntax: `.execute(sql, params=None, commit=False)`
Returns: context manager with cursor as context
Example:
```
with fb.execute('SELECT * FROM patient WHERE id=%s', ['id']) as cursor:
print(cursor.fetchall())
```
### .execute_without_result
Executes sql with params.
Syntax: `.execute_without_result(sql, params=None, commit=False)`
Returns: nothing
Example:
```
fb.execute_without_result('INSERT INTO transaction (resource) VALUES (%s)', ['{}'])
```
### `.row_to_resource`
Transforms row raw from DB to resource.
Syntax: `.row_to_resource(row)`
Returns: resource representation (dict)
Example:
```
fb.row_to_resource({
'resource': {'name': []},
'ts': 'ts',
'txid': 'txid',
'resource_type': 'Patient',
'meta': {'tag': 'created'},
'id': 'id',
}))
```
will return resource representation:
```
{
'id': 'id',
'meta': {'lastUpdated': 'ts', 'versionId': 'txid'},
'name': [],
'resourceType': 'Patient',
}
```
### `.create`
Creates resource.
If txid is not specified, new unique logical transaction id will be generated.
Syntax: `.create(resource, txid=None, commit=True)`
Returns: resource representation (dict)
Example:
```
fb.create({
'resourceType': 'Patient',
'name': [{'text': 'John'}],
})
```
returns
```
{
'resourceType': 'Patient',
'id': 'UNIQUE ID',
'name': [{'text': 'John'}],
'meta': {'lastUpdated': 'timestamp', 'versionId': 'txid'},
}
```
### `.update`
Updates resource.
If txid is not specified, new unique logical transaction id will be generated.
Key `id` is required in `resource` argument.
Syntax: `.update(resource, txid=None, commit=True)`
Returns: resource representation (dict)
Example:
```
fb.update({
'resourceType': 'Patient',
'id': 'id',
'name': [{'text': 'John'}],
})
```
returns
```
{
'resourceType': 'Patient',
'id': 'UNIQUE ID',
'name': [{'text': 'John'}],
'meta': {'lastUpdated': 'timestamp', 'versionId': 'txid'},
}
```
### `.delete`
Deletes resource.
If txid is not specified, new unique logical transaction id will be generated.
Keys `id` and `resourceType` are required in `resource` argument in first variant of usage.
Syntax: `.delete(resource, txid=None, commit=True)` or `.delete(resource_type, id, txid=None, commit=True)`
Returns: nothing
Example:
```
fb.delete({
'resourceType': 'Patient',
'id': 'id',
})
```
or
```
fb.delete(resource_type='Patient', id='id')
```
### `.read`
Reads resource.
Keys `id` and `resourceType` are required in `resource` argument in first variant of usage.
Syntax: `.read(resource)` or `.read(resource_type, id)`
Returns: resource representation (dict)
Example:
```
fb.read({
'resourceType': 'Patient',
'id': 'id',
})
```
or
```
fb.read(resource_type='Patient', id='id')
```
### `.list`
Executes SQL and returns iterator of resources.
Note: sql query must return all fields of resource table.
Syntax: `.list(sql, params)`
Returns: iterator of resources
Example:
```
for patient in fb.list('SELECT * FROM patient'):
print(patient)
```
or
```
patients = list(fb.list('SELECT * FROM patient'))
```
# Example application
To run example, just do:
```
docker-compose build
docker-compose up -d
```
Wait until db starting process will be completed, and run:
```
docker-compose run --rm fhirbase fhirbase init 3.0.1
docker-compose run --rm fhirbasepy python examples/example.py
```
نحوه نصب
نصب پکیج whl fhirbase-0.0.1:
pip install fhirbase-0.0.1.whl
نصب پکیج tar.gz fhirbase-0.0.1:
pip install fhirbase-0.0.1.tar.gz