معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

A command line tool to merge multiple alignments to the same sequence

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	fasta-merge-0.0.2
نام	fasta-merge
نسخه کتابخانه	0.0.2
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Connor Keane
ایمیل نویسنده	connor.keane@kxnr.me
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/kxnr/FASTAMerge
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/fasta-merge/
مجوز	-

# FASTA Merge ## Description A tool to merge multiple FASTA alignments to the same reference sequence. Given multiple files with sequences aligned to the same reference sequence, merge reference sequences and aligned sequences such that both alignment and spacing are preserved. This tool may not be suitable for large files, as it reads the full contents of all provided files into memory. Note: This tool only does rudimentary alignment on the reference sequences. For best results, one of the reference sequences should be a superset of all other reference sequences. If this is not the case, this tool will fall back to aligning all reference sequences pairwise, which requires that all pairs of reference sequences overlap. ## Setup ### Dependencies * python >= 3.6 * argopt * pykxnr ### Installation This project is available through pip as fasta-merge. To install, run: `pip install fasta-merge` OR `python -m pip install fasta-merge` ### Executing program For basic usage, pass the tag name of the reference sequence and a list of files as input. Output can be redirected to a file to save merged alignments. ``` fasta-merge <label> [<file>...] > output.fasta ``` ## Help ``` fasta-merge -h ``` ## Authors * [Connor Keane](kxnr.me)  ## License This project is licensed under the GPL3 License - see the LICENSE.md file for details ## Acknowledgments * Thanks to the CU Boulder Whiteley Lab

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.6	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl fasta-merge-0.0.2:

pip install fasta-merge-0.0.2.whl

نصب پکیج tar.gz fasta-merge-0.0.2:

pip install fasta-merge-0.0.2.tar.gz