معرفی شرکت ها

faim-wako-searchfirst-0.2.0

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.2.0
0.1.0
0.0.1
0.2.0
0.1.0
0.0.1

توضیحات

-
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل faim-wako-searchfirst-0.2.0
نام faim-wako-searchfirst
نسخه کتابخانه 0.2.0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده -
ایمیل نویسنده Jan Eglinger <jan.eglinger@fmi.ch>
آدرس صفحه اصلی -
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/faim-wako-searchfirst/
مجوز -
<!-- SPDX-FileCopyrightText: 2023 Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research (FMI), Basel (Switzerland) SPDX-License-Identifier: MIT --> # FAIM Wako SearchFirst [![DOI](https://zenodo.org/badge/571745733.svg)](https://zenodo.org/badge/latestdoi/571745733) [![test](https://github.com/fmi-faim/faim-wako-searchfirst/actions/workflows/test.yml/badge.svg)](https://github.com/fmi-faim/faim-wako-searchfirst/actions/workflows/test.yml) [![PyPI - Version](https://img.shields.io/pypi/v/faim-wako-searchfirst.svg)](https://pypi.org/project/faim-wako-searchfirst) [![PyPI - Python Version](https://img.shields.io/pypi/pyversions/faim-wako-searchfirst.svg)](https://pypi.org/project/faim-wako-searchfirst) ----- **Table of Contents** - [Installation](#installation) - [License](#license) ## Installation ```console pip install faim-wako-searchfirst ``` ## Usage Configuration is managed in a `config.yml` file: ```yaml file_selection: channel: C01 segmentation: threshold: 128 include_holes: yes min_size: 10 max_size: 99999999999 min_eccentricity: 0.0 max_eccentricity: 0.4 bounding_box: min_x: 0 min_y: 0 max_x: 256 max_y: 256 additional_analysis: enabled: yes target_channel: C03 min_intensity: 128 output: type: grid grid_sampling: mag_first_pass: 4 mag_second_pass: 40 overlap_percent: 0 offset_grid_origin_percent: 50 ``` The Python script called by Wako Automation Software needs to accept the acquisition folder `folder_path` as only parameter: ```python import typer as typer from faim_wako_searchfirst.segment import run def main(folder_path: str): run(folder=folder_path, configfile="config.yml") if __name__ == "__main__": typer.run(main) ``` ## License `faim-wako-searchfirst` is distributed under the terms of the [MIT](https://spdx.org/licenses/MIT.html) license.


نیازمندی

مقدار نام
- confuse
- rich
- scikit-image
- typer


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.7 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl faim-wako-searchfirst-0.2.0:

    pip install faim-wako-searchfirst-0.2.0.whl


نصب پکیج tar.gz faim-wako-searchfirst-0.2.0:

    pip install faim-wako-searchfirst-0.2.0.tar.gz