معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Extract some fastq reads (PE/SE) from the beginning of the files

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	extractfq-0.0.5
نام	extractfq
نسخه کتابخانه	0.0.5
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Guanliang Meng
ایمیل نویسنده	linzhi2012@gmail.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/linzhi2013/extractfq
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/extractfq/
مجوز	-

# extractfq ## 1 Introduction `extractfq` is a tool to extract some fastq reads from the beginning of the files. ## 2 Installation pip install extractfq There will be a command `extractfq` created under the same directory as your `pip` command. ## 3 Usage $ extractfq usage: extractfq.py [-h] [-fq1 <str>] [-fq2 <str>] [-outfq1 <str>] [-outfq2 <str>] [-size_required <float>] [-rl <int>] [-gz] [-cache_num <int>] Extract some fastq reads from the beginning of the files. Author: Guanliang Meng, see https://github.com/linzhi2013/extractfq. This script is part of the package `MitoZ`, when you use the script in your work, please cite: MitoZ: A toolkit for mitochondrial genome assembly, annotation and visualization with NGS data. Guangliang Meng, Yiyuan Li, Chentao Yang, Shanlin Liu (in manuscript) optional arguments: -h, --help show this help message and exit -fq1 <str> input fastq 1 file -fq2 <str> input fastq 2 file -outfq1 <str> output fastq 1 file -outfq2 <str> output fastq 2 file -size_required <float> size required in Gigabase. [3] -rl <int> read length required. discard the smaller ones, and cut the longer ones to this length [None] -gz gzip output. [False] -cache_num <int> the cache number of reads before writing to the file, to speed up. the larger of cache_num, the more memory (default is ca. 2G) will be used. [1500000] ## Author Guanliang MENG ## Citation This script is part of the package `MitoZ`, when you use the script in your work, please cite: Guanliang Meng, Yiyuan Li, Chentao Yang, Shanlin Liu. MitoZ: A toolkit for mitochondrial genome assembly, annotation and visualization; doi: https://doi.org/10.1101/489955

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl extractfq-0.0.5:

pip install extractfq-0.0.5.whl

نصب پکیج tar.gz extractfq-0.0.5:

pip install extractfq-0.0.5.tar.gz