معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

VICC normalization routine for evidence

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	evidence-normalizer-0.0.3a6
نام	evidence-normalizer
نسخه کتابخانه	0.0.3a6
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	VICC
ایمیل نویسنده	help@cancervariants.org
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/cancervariants/evidence-normalization
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/evidence-normalizer/
مجوز	MIT

# Evidence Normalization Service for normalizing evidence ## Developer instructions The following sections include instructions specifically for developers. ### Installation #### Pipenv For a development install, we recommend using Pipenv. See the [pipenv docs](https://pipenv-fork.readthedocs.io/en/latest/#install-pipenv-today) for direction on installing pipenv in your compute environment. Once installed, from the project root dir, just run: ```commandline pipenv shell pipenv lock && pipenv sync ``` #### Pip If you wish to install developer dependencies for `evidence.dev`: ```commandline pip install evidence-normalizer[dev] ``` If you do not need the extra dependencies: ```commandline pip install evidence-normalizer ``` ### Backend Services Evidence Normalization relies on [Variation Normalization](https://github.com/cancervariants/variation-normalization) for normalizing Cancer Hotspots data. You will need to setup backend services and set the appropriate environment variables. See the [README](https://github.com/cancervariants/variation-normalization#variation-normalization) for more information. ### Starting the Evidence Normalization Service Locally To start the service, run the following: ```commandline uvicorn evidence.main:app --reload ``` Next, view the OpenAPI docs on your local machine: http://127.0.0.1:8000/evidence ### Init coding style tests Code style is managed by [flake8](https://github.com/PyCQA/flake8) and checked prior to commit. We use [pre-commit](https://pre-commit.com/#usage) to run conformance tests. This ensures: * Check code style * Check for added large files * Detect AWS Credentials * Detect Private Key Before first commit run: ```commandline pre-commit install ``` ### Running unit tests Running unit tests is as easy as pytest. ```commandline pipenv run pytest ```

نیازمندی

مقدار	نام
-	pydantic
-	requests
-	bravado
-	matplotlib
-	seaborn
-	pandas
-	openpyxl
-	xlrd
-	xlwt
-	fastapi
-	boto3
-	variation-normalizer
-	click

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.7	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl evidence-normalizer-0.0.3a6:

pip install evidence-normalizer-0.0.3a6.whl

نصب پکیج tar.gz evidence-normalizer-0.0.3a6:

pip install evidence-normalizer-0.0.3a6.tar.gz