معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Export binary Open Ephys data to NWB 2.x

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	esi-oephys2nwb-2022.5rc0
نام	esi-oephys2nwb
نسخه کتابخانه	2022.5rc0
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Ernst Strüngmann Institute (ESI) for Neuroscience in Cooperation with Max Planck Society
ایمیل نویسنده	it@esi-frankfurt.de
آدرس صفحه اصلی	https://esi-oephys2nwb.readthedocs.io/en/latest/
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/esi-oephys2nwb/
مجوز	BSD-3

# oephys2nwb: Export Open Ephys binary data to NWB 2.x ## Summary This package can be used to export data saved in [Open Ephys binary format](https://open-ephys.github.io/gui-docs/User-Manual/Recording-data/Binary-format.html) (the default for the Open Ephys GUI) to the [NWB 2.0 format](https://www.nwb.org/). At the time of writing the [NWBFormat plugin](https://open-ephys.github.io/gui-docs/User-Manual/Recording-data/NWB-format.html) of Open Ephys only supports the deprecated NWB 1.0 format specification. The present package is developed and maintained at the [Ernst Strüngmann Institute (ESI) gGmbH for Neuroscience in Cooperation with Max Planck Society](https://www.esi-frankfurt.de/>) and released free of charge under the [BSD 3-Clause "New" or "Revised" License](https://en.wikipedia.org/wiki/BSD_licenses#3-clause_license_(%22BSD_License_2.0%22,_%22Revised_BSD_License%22,_%22New_BSD_License%22,_or_%22Modified_BSD_License%22)). ## Installation The package can be installed with `pip` ```shell pip install git+https://github.com/open-ephys/open-ephys-python-tools pip install esi-oephys2nwb ``` To get the latest development version, simply clone our GitHub repository and (optionally) create a dedicated conda development environment: ```shell git clone https://github.com/esi-neuroscience/oephys2nwb.git cd oephys2nwb/ python setup.py --version conda env create -f oephys2nwb-dev.yml conda activate oephys2nwb-dev pip install -e . ``` ## Usage We recommend setting up a dedicated conda environment for `oephys2nwb`. For general information about conda, please refer to the [official documentation](https://docs.conda.io/en/latest/). ```shell conda create -n oephys2nwb-env python=3.8 pip conda activate oephys2nwb-env pip install esi-oephys2nwb ``` Alternatively, we provide a conda environment file to automatically install all required dependencies ```shell wget https://raw.githubusercontent.com/esi-neuroscience/oephys2nwb/main/oephys2nwb.yml conda env create -f oephys2nwb.yml conda activate oephys2nwb ``` Once the package is installed the exporter can be used either embedded in Python code or as a stand-alone command line utility. ### Command Line Activate the conda environment the package was installed in and invoke the exporter as follows ```shell conda activate oephys2nwb-env python -m oephys2nwb -i /path/to/recordingDir -o /path/to/outputFile.nwb ``` Calling `oephys2nwb` without arguments prints the function help ```shell python -m oephys2nwb ``` ### Python Code Alternatively, the package can be used like any other Python module ```python from oephys2nwb import export2nwb input = "/path/to/recordingDir" output = "/path/to/outputFile.nwb" export2nwb(input, output) ``` ## Documentation and Contact To report bugs or ask questions please use our [GitHub issue tracker](https://github.com/esi-neuroscience/oephys2nwb/issues). More usage details and background information is available in our [online documentation](https://esi-oephys2nwb.readthedocs.io/en/latest/).

نیازمندی

مقدار	نام
-	ndx-events
-	pydantic
-	pynwb
-	ipdb
-	ipython
-	numpydoc
-	sphinx-automodapi
-	sphinx-bootstrap-theme

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.7	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl esi-oephys2nwb-2022.5rc0:

pip install esi-oephys2nwb-2022.5rc0.whl

نصب پکیج tar.gz esi-oephys2nwb-2022.5rc0:

pip install esi-oephys2nwb-2022.5rc0.tar.gz