معرفی شرکت ها


epivizFileServer-0.2.7


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

A python library to interact, explore and compute data directly from genomic files.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل epivizFileServer-0.2.7
نام epivizFileServer
نسخه کتابخانه 0.2.7
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Jayaram Kancherla
ایمیل نویسنده jayaram.kancherla@gmail.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/epiviz/epivizFileParser
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/epivizFileServer/
مجوز mit
================== Epiviz File Server ================== .. image:: https://readthedocs.org/projects/epivizfileserver/badge/?version=latest :target: https://epivizfileserver.readthedocs.io/en/latest/?badge=latest :alt: Documentation Status .. image:: https://travis-ci.org/epiviz/epivizFileServer.svg?branch=master :target: https://travis-ci.org/epiviz/epivizFileServer Compute and Query Parser for Genomic Files Description =========== Epiviz file Server is a Python library, to query genomic files, not only for visualization but also for transformation. The library provides various modules to perform various tasks - - Parser to read various genomic file formats, - Query to access only necessary bytes of file, - Compute to apply transformations on data, - Server to instantly convert the datasets into an API and - Visualization. A quick overview of the library and its features, are described in an IPython notebook available at - https://epiviz.github.io/post/2019-02-04-epiviz-fileserver/ Note ==== 1. The library requires the server hosting the data files to support HTTP range requests so that the file server's parser module can only request the necessary byte-ranges needed to process the query 2. The library currently supports indexed genomic file formats like BigWig, BigBed, Bam (with bai), Sam (with sai) or any genomic data file that can be indexed using tabix. Developer Notes =============== This project has been set up using PyScaffold 3.1. For details and usage information on PyScaffold see https://pyscaffold.org/. use a virtualenv for testing & development. To setup run the following commands from the project directory .. code-block:: python virtualenv env --python=python3 source env/bin/activate # (activate.fish if using the fish-shell) pip install -r requirements.txt # to deactivate virtualenv deactivate 1. Test - ```python setup.py test``` 2. Docs - ```python setup.py docs``` 3. Build - source distribution ```python setup.py sdist``` - binary distribution ```python setup.py bdist``` - wheel distribution ```python setup.py bdist_wheel```


نیازمندی

مقدار نام
- numpy
- scipy
- aiocache
- dask[complete]
- distributed
- pandas
- requests
- sanic
- Sanic-Cors
- pysam
- h5py
- ujson
- docopt
- tqdm
- tiledb
- pytest
- pytest-cov


نحوه نصب


نصب پکیج whl epivizFileServer-0.2.7:

    pip install epivizFileServer-0.2.7.whl


نصب پکیج tar.gz epivizFileServer-0.2.7:

    pip install epivizFileServer-0.2.7.tar.gz