معرفی شرکت ها

ena-utils-0.2.1

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.2.1
0.1.3
0.1.2
0.1.1
0.1.0
0.2.1
0.1.3
0.1.2
0.1.1
0.1.0

توضیحات

A simple CLI toolbox to use the European Nucleotide Archive (ENA)
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل ena-utils-0.2.1
نام ena-utils
نسخه کتابخانه 0.2.1
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Laboratory of Integrative System Physiology (LISP) at EPFL
ایمیل نویسنده alexis.rapin@epfl.ch
آدرس صفحه اصلی https://github.com/auwerxlab/ena-utils
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/ena-utils/
مجوز Apache License 2.0
================================================================================================= A simple CLI toolbox to use the `European Nucleotide Archive (ENA) <https://www.ebi.ac.uk/ena/>`_ ================================================================================================= .. image:: https://img.shields.io/badge/license-apache2-brightgreen.svg :target: https://github.com/auwerxlab/ena-utils/blob/master/LICENSE .. image:: https://img.shields.io/github/v/release/auwerxlab/ena-utils :target: https://github.com/auwerxlab/ena-utils/releases .. image:: https://img.shields.io/pypi/v/ena-utils :target: https://pypi.python.org/pypi/ena-utils .. image:: https://readthedocs.org/projects/ena-utils/badge/?version=latest :target: https://ena-utils.readthedocs.io/en/latest/?badge=latest :alt: Documentation Status **ena-utils** is a small python package that provides a CLI to submit nucleotides sequences to the `European Nucleotide Archive (ENA) <https://www.ebi.ac.uk/ena/>`_. The goals of this package are: 1. To facilitate the submission of large numbers of objects 2. To ease the exploitation of the ENA metadata schema to its full potential (see the **Future developments** section below) This is an early development version that provides only minimal features. Supported submission types ========================== - Non-multiplexed paired-end sequencing reads Features ======== - File upload - Study registration - Experiment registration - Run registration - Sample registration Requirements ============ - Python3 - Webin account Installation ============ The latest release is available on PyPI and can be installed using ``pip``: :: $ pip install ena-utils Isolated environments using ``pipx`` ------------------------------------ Install and execute ena-utils in an isolated environment using ``pipx``. `Install pipx <https://github.com/pipxproject/pipx#install-pipx>`_ and make sure that the ``$PATH`` is correctly configured. :: $ python3 -m pip install --user pipx $ pipx ensurepath Once ``pipx`` is installed use following command to install ``ena-utils``. :: $ pipx install ena-utils $ which ena-utils ~/.local/bin/ena-utils Usage ===== The latest documentation is available at `https://readthedocs.org <https://ena-utils.readthedocs.io/en/latest/>`_. Future developments =================== - Auto-generation of the CLI and objects lists templates from the ENA schema XSD files.


نیازمندی

مقدار نام
>=7.0 click
>=1.1.0 pandas
>=0.12.0 xmltodict


نحوه نصب


نصب پکیج whl ena-utils-0.2.1:

    pip install ena-utils-0.2.1.whl


نصب پکیج tar.gz ena-utils-0.2.1:

    pip install ena-utils-0.2.1.tar.gz