معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Event-driven acquisition

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	eda-plugin-0.2.9
نام	eda-plugin
نسخه کتابخانه	0.2.9
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Willi L. Stepp
ایمیل نویسنده	willi.stepp@epfl.ch
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/wl-stepp/eda_plugin
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/eda-plugin/
مجوز	-

# Event-driven acquisition (EDA) 'event-driven-acquisition' is a Python library for advanced microscope control routines to enable acquisitions to react to specific biological events of interest. More information on the project it was first used on can be found in the [bioRxiv article](https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.10.04.463102v1). See the [Documentation](https://event-driven-acquisition.readthedocs.io/en/latest/index.html) for more details. ## Components of EDA ### Analyzers Analyzers receive an image or images from the microscope. Their task is to reduce the information in these images to a single or a set of parameters. These parameters are passed on to interpreters. ### Interpreters An interpreter receives parameters from an analyzer and uses these to take a decision for how to proceed with acquisition. This decision is passed on to an actuator. The interpretation can for example take into account the temporal context of results from the analyzer. ### Actuators The responsibility of an actuator is both to handle start/stop of acquisitions and to apply the decisions from an interpreter to the ongoing acquisition. ## Installing Event-driven acquisition 1) Install the latest version of [micro-manager2.0](https://micro-manager.org/wiki/Micro-Manager_Nightly_Builds) 2) `pip install eda_plugin` 3) Install the Micro-Manager plugins: 1) `>>> import eda_plugin` 2) `>>> eda_plugin.install_mm_plugins()` 3) Choose the main Micro-Manager folder in the file dialog (e.g. C:\Program Files\Micro-Manager-2.0) 4) Run micro-manager with the zmq server ([pycromanager installation](https://github.com/micro-manager/pycro-manager/blob/master/README.md)) 5) Run the PythonEventServer from Plugins -> Developer Tools -> Python Event Server Now you can run one of the examples ```python import eda_plugin eda_plugin.examples.basic() # or if you have CUDA and tensorflow installed eda_plugin.examples.pyro() ``` Or construct your own EDA loop e.g. ```python import sys from PyQt5 import QtWidgets from eda_plugin.utility.event_bus import EventBus import eda_plugin.utility.settings from eda_plugin.eda_gui import EDAMainGUI from eda_plugin.interpreters.frame_rate import BinaryFrameRateInterpreter from eda_plugin.analysers.image import ImageAnalyser from eda_plugin.actuators.micro_manager import MMActuator, TimerMMAcquisition eda_plugin.utility.settings.setup_logging() app = QtWidgets.QApplication(sys.argv) event_bus = EventBus() gui = EDAMainGUI(event_bus, viewer=True) actuator = MMActuator(event_bus, TimerMMAcquisition) analyser = ImageAnalyser(event_bus) interpreter = BinaryFrameRateInterpreter(event_bus) gui.show() actuator.gui.show() interpreter.gui.show() sys.exit(app.exec_()) ```

نیازمندی

مقدار	نام
-	pyqt5
-	pycromanager
-	pyqtgraph
-	qimage2ndarray
-	qdarkstyle
-	tifffile
-	zenodo-get
-	docstring-inheritance
-	zarr
-	ome-zarr
-	pymm-eventserver

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.7	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl eda-plugin-0.2.9:

pip install eda-plugin-0.2.9.whl

نصب پکیج tar.gz eda-plugin-0.2.9:

pip install eda-plugin-0.2.9.tar.gz