معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Converts Dynamo table files to RELION star files

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	dynamo2relion-1.0.0
نام	dynamo2relion
نسخه کتابخانه	1.0.0
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Euan Pyle
ایمیل نویسنده	euanpyle@gmail.com
آدرس صفحه اصلی	-
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/dynamo2relion/
مجوز	BSD 3-Clause License

# Dynamo2Relion ## A Tiny Function to Convert Dynamo Tables to Star Files for RELION 4.0 [![PyPI pyversions](https://img.shields.io/pypi/pyversions/dynamo2m.svg)](https://pypi.python.org/pypi/dynamo2m/) Based on [dynamo2m](https://github.com/alisterburt/dynamo2m) by Alister Burt. ## Installation Installation is carried out via: ```sh pip install dynamo2relion ``` ## Requirements Your directory containing the tilt series directories must be structured as follows: ```sh tilt_series_directory #Directory containing all TS directories, link to this directory | --> TS_01 #Directory containing TS_01 | --> TS_01.mrc #TS_01 image stack. The file extension does not matter. | --> TS_02 | -->TS_02.mrc # | --> etc... ``` The program will ask you the path to tilt_series_directory. No directories other than the TS_* directories should be present in tilt_series_directory. Naming convention for the TS_* directories can be any mix of upper of lower case TS and any numbering convention desired. ## Usage Instructions for use can be found via typing: ```sh dynamo2relion --help ``` For binning level, simply enter 1 if the coordinates of your particles in the Dynamo table were picked from an unbinned tomogram. If the tomograms the particles were picked in were binned, add the correct binning level: binning is done using IMOD convention, i.e. for a pixel size of 1 A/px, a binning level of 8 would yield 8 A/px.

نیازمندی

مقدار	نام
-	starfile
-	dynamotable
-	eulerangles
-	typer
-	pandas
>=6.0	pytest
-	pytest-cov

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.6	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl dynamo2relion-1.0.0:

pip install dynamo2relion-1.0.0.whl

نصب پکیج tar.gz dynamo2relion-1.0.0:

pip install dynamo2relion-1.0.0.tar.gz