معرفی شرکت ها
drug-database-0.1.3
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Tool for getting scaling factors from different drugs
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | drug-database-0.1.3 |
| نام | drug-database |
| نسخه کتابخانه | 0.1.3 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | - |
| ایمیل نویسنده | Henrik Finsberg <henriknf@simula.no> |
| آدرس صفحه اصلی | - |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/drug-database/ |
| مجوز | Copyright 2022 Henrik Finsberg Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction, including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is furnished to do so, subject to the following conditions: The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or substantial portions of the Software. THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE. |
[](https://github.com/ComputationalPhysiology/drug-database/blob/main/LICENSE)
[](https://github.com/ComputationalPhysiology/drug-database/actions/workflows/main.yml)
[](https://github.com/ComputationalPhysiology/drug-database/actions/workflows/pre-commit.yml)
[](https://github.com/ComputationalPhysiology/drug-database/actions/workflows/build_docs.yml)
# Drug database
Simple command line interface for getting scaling factors for different drugs
- Documentation: https://ComputationalPhysiology.github.io/drug-database/
- Source code: https://github.com/ComputationalPhysiology/drug-database
## Install
```
$ python -m pip install drug-database
```
Once installed you will get access to the `drug-db` command.
## Usage
Get help using
```
$ drug-db --help
```
### List all available drugs
```
$ drug-db list-drugs
Drugs
┏━━━━━━━━━━━━━━━━┓
┃ Name ┃
┡━━━━━━━━━━━━━━━━┩
│ Sotalol │
│ Azimilide │
│ Ibutilide │
│ Risperidone │
│ Clarithromycin │
│ Terfenadine │
│ Bepridil │
│ Pimozide │
│ Dofetilide │
│ Disopyramide │
│ Cisapride │
│ Tamoxifen │
│ Vandetanib │
│ Metropolol │
│ Droperidol │
│ Loratadine │
│ Ranolazine │
│ Quinidine │
│ Diltiazem │
│ Astemizole │
│ Nitrendipine │
│ Chlorpromazine │
│ Clozapine │
│ Control │
│ Nifedipine │
│ Verapamil │
│ Domperidone │
│ Ondansetron │
│ Mexiletine │
└────────────────┘
```
### Showing information about specific drug
```
$ drug-db show-drug Verapamil
Scaling factors for drug
Verapamil and FPC 1
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓
┃ Name ┃ Value ┃
┡━━━━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩
│ scale_drug_INa │ 1.0 │
│ scale_drug_INaL │ 1.0 │
│ scale_drug_Ito │ 1.0 │
│ scale_drug_ICaL │ 0.7342 │
│ scale_drug_IKr │ 0.8815 │
│ scale_drug_IKs │ 1.0 │
│ scale_drug_IK1 │ 1.0 │
│ scale_drug_IKb │ 1.0 │
│ scale_drug_INab │ 1.0 │
│ scale_drug_ICab │ 1.0 │
│ scale_drug_IpCa │ 1.0 │
│ scale_drug_Isacns │ 1.0 │
│ scale_drug_Isack │ 1.0 │
└───────────────────┴────────┘
```
Note that this is showing the values that are 1 times FPC (FIXME: explain what this means). If you want to get the values for 5 times FPC the you can do
```
$ drug-db show-drug Verapamil --fpc 5
Scaling factors for drug
Verapamil and FPC 5
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓
┃ Name ┃ Value ┃
┡━━━━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩
│ scale_drug_INa │ 1.0 │
│ scale_drug_INaL │ 0.9997 │
│ scale_drug_Ito │ 1.0 │
│ scale_drug_ICaL │ 0.3199 │
│ scale_drug_IKr │ 0.5588 │
│ scale_drug_IKs │ 1.0 │
│ scale_drug_IK1 │ 1.0 │
│ scale_drug_IKb │ 1.0 │
│ scale_drug_INab │ 1.0 │
│ scale_drug_ICab │ 1.0 │
│ scale_drug_IpCa │ 1.0 │
│ scale_drug_Isacns │ 1.0 │
│ scale_drug_Isack │ 1.0 │
└───────────────────┴────────┘
```
### json support
By default the tables are displayed in a [Rich table](https://rich.readthedocs.io/en/stable/tables.html), however sometimes you might want to use these values in another program in which you can convert the values to json by using the `--json` flag, e.g
```
$ drug-db show-drug Verapamil --fpc 5 --json
{"scale_drug_INa": 1.0, "scale_drug_INaL": 0.9997, "scale_drug_Ito": 1.0, "scale_drug_ICaL": 0.3199, "scale_drug_IKr": 0.5588, "scale_drug_IKs": 1.0, "scale_drug_IK1": 1.0, "scale_drug_IKb": 1.0,
"scale_drug_INab": 1.0, "scale_drug_ICab": 1.0, "scale_drug_IpCa": 1.0, "scale_drug_Isacns": 1.0, "scale_drug_Isack": 1.0}
```
You can also save this to a file using e.g
```
$ drug-db show-drug Verapamil --fpc 5 --json > verapamil_5.json
```
## License
MIT
## Author
Henrik Finsberg (henriknf@simula.no)
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | typer |
| - | rich |
| - | drug-database[test] |
| - | drug-database[docs] |
| - | drug-database[dev] |
| - | pdbpp |
| - | ipython |
| - | bump2version |
| - | pre-commit |
| - | jupyter-book |
| - | jupytext |
| - | plotly |
| <8.7.0 | ipython |
| - | pytest |
| - | pytest-cov |
نحوه نصب
نصب پکیج whl drug-database-0.1.3:
pip install drug-database-0.1.3.whl
نصب پکیج tar.gz drug-database-0.1.3:
pip install drug-database-0.1.3.tar.gz