معرفی شرکت ها
dreem-0.1.8
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
DREEM solves RNA structure ensembles using chemical probing data
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | dreem-0.1.8 |
| نام | dreem |
| نسخه کتابخانه | 0.1.8 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | Silvi Rouskin Lab |
| ایمیل نویسنده | silvi@hms.harvard.edu |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/rouskinlab/dreem |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/dreem/ |
| مجوز | - |
[](https://github.com/rouskinlab/dreem/actions/workflows/documentation.yml)
[](https://github.com/rouskinlab/dreem/actions/workflows/tests.yaml)
# DREEM
Prof. Silvi Rouskin's [DREEM algorithm](https://www.nature.com/articles/s41586-020-2253-5).
## Installation
Installation instructions [here](https://rouskinlab.github.io/dreem/dreem/installation.html).
## Documentation
The documentation is available on [Github Pages](https://rouskinlab.github.io/dreem).
## Contributors
Yves Martin, Scott Grote, Matthew Allan, Albéric de Lajarte.
## For developers
Before pushing to main, ensure that the code passes the tests:
```
pytest test/test_pipeline.py
```
and that the docs compile:
```
cd docs
make html
```
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| ==0.7.13 | alabaster |
| ==0.1.3 | appnope |
| ==2.0.0 | argcomplete |
| ==1.2.3 | arrow |
| ==2.1.0 | asttokens |
| ==1.10 | async-generator |
| ==22.1.0 | attrs |
| ==0.1.2 | autoreload |
| ==2.11.0 | babel |
| ==0.2.0 | backcall |
| ==0.4.4 | binaryornot |
| ==5.0.1 | bleach |
| ==3.0.0 | blockdiag |
| ==0.9.0 | build |
| ==5.1.0 | chardet |
| ==3.0.1 | charset-normalizer |
| ==8.1.3 | click |
| ==0.5.5 | click-option-group |
| ==6.7.0 | colorlog |
| ==0.9.1 | commonmark |
| ==1.0.6 | contourpy |
| ==2.1.1 | cookiecutter |
| ==0.7.0 | cssselect2 |
| ==2.4.1 | custom-inherit |
| >=4.1 | cutadapt |
| ==0.11.0 | cycler |
| ==1.6.3 | debugpy |
| ==5.1.1 | decorator |
| ==0.3.6 | distlib |
| >=0.1.0 | dms-ci |
| ==0.10.0 | dnaio |
| ==0.17.1 | docutils |
| ==0.12.3 | editorconfig |
| ==0.4 | entrypoints |
| ==1.1.10 | enum34 |
| ==1.0.4 | exceptiongroup |
| ==1.2.0 | executing |
| ==1.2.0 | fastqsplitter |
| ==3.9.0 | filelock |
| ==4.38.0 | fonttools |
| ==1.0.1 | funcparserlib |
| ==0.14.0 | h11 |
| ==3.4 | idna |
| ==1.4.1 | imagesize |
| ==6.0.0 | importlib-metadata |
| ==1.1.1 | iniconfig |
| ==3.2.3 | jaraco.classes |
| ==0.18.2 | jedi |
| ==3.1.2 | jinja2 |
| ==0.2.0 | jinja2-time |
| ==1.2.0 | joblib |
| ==1.14.7 | jsbeautifier |
| ==23.13.1 | keyring |
| ==1.4.4 | kiwisolver |
| ==0.39.1 | llvmlite |
| ==4.9.1 | lxml |
| ==2.1.2 | markupsafe |
| ==3.6.2 | matplotlib |
| ==0.1.6 | matplotlib-inline |
| ==9.0.0 | more-itertools |
| ==1.5.6 | nest-asyncio |
| ==2022.11.21 | nox |
| ==0.56.4 | numba |
| ==1.23.4 | numpy |
| ==1.2.0 | outcome |
| ==21.3 | packaging |
| ==1.5.2 | pandas |
| ==0.8.3 | parso |
| ==0.13.0 | pep517 |
| ==4.8.0 | pexpect |
| ==0.7.5 | pickleshare |
| ==9.3.0 | pillow |
| ==6.10.0 | pip-tools |
| ==1.9.6 | pkginfo |
| ==2.5.4 | platformdirs |
| ==5.11.0 | plotly |
| ==1.0.0 | pluggy |
| ==3.0.33 | prompt-toolkit |
| ==5.9.4 | psutil |
| ==0.7.0 | ptyprocess |
| ==0.2.2 | pure-eval |
| ==0.10.9.5 | py4j |
| ==21.10.1 | pyaml |
| ==10.0.1 | pyarrow |
| ==1.10.4 | pydantic |
| ==2.13.0 | pygments |
| ==3.0.9 | pyparsing |
| ==1.7.1 | pysocks |
| ==3.3.1 | pyspark |
| ==7.2.0 | pytest |
| ==2.8.2 | python-dateutil |
| ==8.0.1 | python-slugify |
| ==2022.6 | pytz |
| ==6.0 | pyyaml |
| ==24.0.1 | pyzmq |
| ==37.3 | readme-renderer |
| ==0.7.1 | recommonmark |
| ==3.6.12 | reportlab |
| ==2.28.2 | requests |
| ==0.10.1 | requests-toolbelt |
| ==2.0.0 | rfc3986 |
| ==13.0.1 | rich |
| ==1.1.3 | scikit-learn |
| ==1.9.3 | scipy |
| ==0.12.1 | seaborn |
| ==4.7.2 | selenium |
| ==1.16.0 | six |
| ==1.3.0 | sniffio |
| ==2.2.0 | snowballstemmer |
| ==2.4.0 | sortedcontainers |
| ==4.5.0 | sphinx |
| ==0.6.0 | sphinx-panels |
| ==1.1.1 | sphinx-rtd-theme |
| ==3.0.0 | sphinxcontrib-blockdiag |
| ==1.0.2 | sphinxcontrib-devhelp |
| ==2.0.1 | sphinxcontrib-htmlhelp |
| ==1.0.1 | sphinxcontrib-jsmath |
| ==1.0.3 | sphinxcontrib-qthelp |
| ==1.1.5 | sphinxcontrib-serializinghtml |
| ==4.4.0 | sphinx-click |
| ==0.6.1 | stack-data |
| ==1.4.1 | svglib |
| ==8.1.0 | tenacity |
| ==1.3 | text-unidecode |
| ==3.1.0 | threadpoolctl |
| ==1.2.1 | tinycss2 |
| ==2.0.1 | tomli |
| ==6.2 | tornado |
| ==4.64.1 | tqdm |
| >=5.1 | traitlets |
| ==0.22.0 | trio |
| ==0.9.2 | trio-websocket |
| ==4.5.0 | typing-extensions |
| ==1.26.13 | urllib3 |
| ==20.20.0 | virtualenv |
| ==2.2.0 | watchdog |
| ==0.2.5 | wcwidth |
| ==1.12 | webcolors |
| ==0.5.1 | webencodings |
| ==1.2.0 | wsproto |
| ==1.7.0 | xopen |
| ==3.11.0 | zipp |
زبان مورد نیاز
| مقدار | نام |
|---|---|
| >=3.10 | Python |
نحوه نصب
نصب پکیج whl dreem-0.1.8:
pip install dreem-0.1.8.whl
نصب پکیج tar.gz dreem-0.1.8:
pip install dreem-0.1.8.tar.gz