معرفی شرکت ها

doepipeline-1.1.1

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
1.1.1
1.1.0

توضیحات

Package for optimizing pipelines using DoE.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل doepipeline-1.1.1
نام doepipeline
نسخه کتابخانه 1.1.1
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Rickard Sjogren
ایمیل نویسنده rickard.sjogren@umu.se
آدرس صفحه اصلی https://github.com/clicumu/doepipeline
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/doepipeline/
مجوز MIT
# doepipeline This is yet another pipeline package. What distinguishes `doepipeline` is that it enables pipeline optimization using methodologies from statistical [Design of Experiments (DOE)](https://en.wikipedia.org/wiki/Design_of_experiments). # Features * Community developed: Users are welcome to contribute to add additional funtionality. . * Installation: Easy installation through [conda](http://conda-forge.org/) or [PyPI](https://pypi.org/). * Generic: The optimization is useful for all kinds of CLI applications. # Quick start links Take a look at the [wiki documentation](https://github.com/clicumu/doepipeline/wiki) to getting started using doepipeline. Briefly, the following steps are needed to start using doepipeline. 1. [Install doepipeline](https://github.com/clicumu/doepipeline/wiki/Installation) 2. [Create configuration file](https://github.com/clicumu/doepipeline/wiki/Configuration-file) 3. [Run optimization](https://github.com/clicumu/doepipeline/wiki/Usage) Four example cases (including data and configuration) are provided to as help getting started; 1) [de-novo genome assembly](https://github.com/clicumu/doepipeline/wiki/Case-1) 2) [scaffolding of a fragmented genome assembly](https://github.com/clicumu/doepipeline/wiki/Case-2) 3) [k-mer taxonomic classification of ONT MinION reads](https://github.com/clicumu/doepipeline/wiki/Case-3) 4) [genetic variant calling](https://github.com/clicumu/doepipeline/wiki/Case-4) # Cite __doepipeline: a systematic approach for optimizing multi-level and multi-step data processing workflows__ Svensson D, Sjögren R, Sundell D, Sjödin A, Trygg J BioRxiv doi: https://doi.org/10.1101/504050 # About this software doepipeline is implemented as a Python package. It is open source software made available under the [MIT license](LICENSE). If you experience any difficulties with this software, or you have suggestions, or want to contribute directly, you have the following options: - submit a bug report or feature request to the [issue tracker](https://github.com/clicumu/doepipeline/issues) - contribute directly to the source code through the [github](https://github.com/clicumu/doepipeline) repository. 'Pull requests' are especially welcome.


نحوه نصب


نصب پکیج whl doepipeline-1.1.1:

    pip install doepipeline-1.1.1.whl


نصب پکیج tar.gz doepipeline-1.1.1:

    pip install doepipeline-1.1.1.tar.gz