معرفی شرکت ها

dockerasmus-0.1.1

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.1.1
0.1.0
0.1.1
0.1.0

توضیحات

An easy to use docking library.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل dockerasmus-0.1.1
نام dockerasmus
نسخه کتابخانه 0.1.1
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Martin Larralde
ایمیل نویسنده martin.larralde@ens-cachan.fr
آدرس صفحه اصلی https://gitlab.com/althonos/dockerasmus
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/dockerasmus/
مجوز GPLv3
dockerasmus ======================================= *docking itself through university* |version| |docs| |pyversions| |gl| |build| |coverage| |license| |grade| |wheel| .. |version| image:: https://img.shields.io/pypi/v/dockerasmus.svg :target: https://pypi.python.org/pypi/dockerasmus .. |docs| image:: http://readthedocs.org/projects/dockerasmus/badge/?version=latest :target: http://dockerasmus.readthedocs.io/en/latest/?badge=latest .. |pyversions| image:: https://img.shields.io/pypi/pyversions/dockerasmus.svg :target: https://pypi.python.org/pypi/dockerasmus .. |build| image:: https://gitlab.com/althonos/dockerasmus/badges/master/build.svg :target: https://gitlab.com/althonos/dockerasmus/pipelines?scope=branches .. |coverage| image:: https://img.shields.io/codecov/c/token/eNxJwF5lhn/gitlab/althonos/dockerasmus.svg :target: https://codecov.io/gl/althonos/dockerasmus .. |gl| image:: https://img.shields.io/badge/repository-gitlab-orange.svg :target: https://gitlab.com/althonos/dockerasmus .. |license| image:: https://img.shields.io/badge/license-GPLv3-blue.svg :target: https://choosealicense.com/licenses/gpl-3.0/ .. |grade| image:: https://api.codacy.com/project/badge/Grade/87e03271b04e4154a3b513bddb0d08bc :target: https://www.codacy.com/app/althonos/dockerasmus .. |wheel| image:: https://img.shields.io/pypi/wheel/dockerasmus.svg :target: https://pypi.python.org/pypi/dockerasmus Introduction ------------ ``dockerasmus`` is a version-agnostic Python module that was created to quickly solve docking problems, as part of a Python assignment from the M1 BIBS of the Université Paris-Saclay. ``dockerasmus`` provides a generic implementation of a scoring function, which can be used with several *components* to compute the score of a docking conformation involving two proteins. It is backend agnostic, and every scoring component can be rewritten with any library supporting ``numpy`` arrays. Example ------- Use ``dockerasmus`` to compute the score of the barnase-barstar complex using the scoring function defined by `Cornell et al <http://dx.doi.org/10.1021/ja00124a002>`_: .. code:: python from dockerasmus.pdb import Protein from dockerasmus.score import ScoringFunction, components # Import the pdb files (supports gzipped files or plain .pdb) barnase = Protein.from_pdb_file("tests/data/barnase.native.pdb.gz") barstar = Protein.from_pdb_file("tests/data/barstar.native.pdb.gz") # Create a scoring function with two components scoring_function = ScoringFunction(components.LennardJones, components.Coulomb) # Call the scoring function on the barnase (receptor) # and the barstar (ligand) scoring_function(barnase, barstar) # -84.94... API --- ``dockerasmus`` provides several submodules: * a parser & object model for the Protein Data Bank (``dockerasmus.pdb``) * a scoring library (``dockerasmus.score``) * a soft 3D engine for spatial transformations (``dockerasmus.spatial``) See the `API reference <http://dockerasmus.readthedocs.io/en/latest/api/>`_ from the online documentation to get more details. License ------- ``dockerasmus`` is fully open-source and is released under the GPLv3.


نحوه نصب


نصب پکیج whl dockerasmus-0.1.1:

    pip install dockerasmus-0.1.1.whl


نصب پکیج tar.gz dockerasmus-0.1.1:

    pip install dockerasmus-0.1.1.tar.gz