معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Read and write FASTA and FASTQ files efficiently

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	dnaio-0.9.1
نام	dnaio
نسخه کتابخانه	0.9.1
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Marcel Martin
ایمیل نویسنده	marcel.martin@scilifelab.se
آدرس صفحه اصلی	https://dnaio.readthedocs.io/
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/dnaio/
مجوز	MIT

.. image:: https://github.com/marcelm/dnaio/workflows/CI/badge.svg :alt: GitHub Actions badge .. image:: https://img.shields.io/pypi/v/dnaio.svg?branch=main :target: https://pypi.python.org/pypi/dnaio :alt: PyPI badge .. image:: https://codecov.io/gh/marcelm/dnaio/branch/master/graph/badge.svg :target: https://codecov.io/gh/marcelm/dnaio :alt: Codecov badge ===================================== dnaio processes FASTQ and FASTA files ===================================== ``dnaio`` is a Python 3.7+ library for very efficient parsing and writing of FASTQ and also FASTA files. The code was previously part of the `Cutadapt <https://cutadapt.readthedocs.io/>`_ tool and has been improved significantly since it has been split out. Example usage ============= The main interface is the `dnaio.open <https://dnaio.readthedocs.io/en/latest/api.html>`_ function:: import dnaio with dnaio.open("reads.fastq.gz") as f: bp = 0 for record in f: bp += len(record) print(f"The input file contains {bp/1E6:.1f} Mbp") For more, see the `tutorial <https://dnaio.readthedocs.io/en/latest/tutorial.html>`_ and `API documentation <https://dnaio.readthedocs.io/en/latest/api.html>`_. Features and supported file types ================================= - FASTQ input and output - FASTA input and output - Compressed input and output (``.gz``, ``.bz2`` and ``.xz``, detected automatically) - Paired-end data in two files - Interleaved paired-end data in a single file - Files with DOS/Windows linebreaks can be read - FASTQ files with a second header line (after the ``+``) are supported Limitations =========== - Multi-line FASTQ files are not supported. - FASTQ parsing is the focus of this library. The FASTA parser is not as optimized. Links ===== * `Documentation <https://dnaio.readthedocs.io/>`_ * `Source code <https://github.com/marcelm/dnaio/>`_ * `Report an issue <https://github.com/marcelm/dnaio/issues>`_ * `Project page on PyPI <https://pypi.python.org/pypi/dnaio/>`_

نیازمندی

مقدار	نام
>=1.4.0	xopen
-	Cython
-	pytest

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.7	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl dnaio-0.9.1:

pip install dnaio-0.9.1.whl

نصب پکیج tar.gz dnaio-0.9.1:

pip install dnaio-0.9.1.tar.gz