معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	digipath-mltk-0.0.0
نام	digipath-mltk
نسخه کتابخانه	0.0.0
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	DigiPath_MLTK development team
ایمیل نویسنده	-
آدرس صفحه اصلی	https://ncsa.github.io/DigiPath_MLTK/
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/digipath-mltk/
مجوز	-

# Parameterized large image pre-processing with _*pychunklbl.toolkit*_ The package module _*pychunklbl.toolkit*_ provides eight parameterized functions designed to work with large image files and provide pre-processing for machine learning. The package module is intended developers to create machine learning datasets leveraging the [openslide](https://openslide.org/) library for usage with [tensorflow 2.0](https://www.tensorflow.org/). **** ## Installation ``` pip install digipath_mltk # requires python 3.5 or later pip3 install -r requirements.txt ``` ### Development install from clone in /DigiPath_MLTK/ directory: ``` pip3 install -r requirements.txt pip3 install --upgrade ../DigiPath_MLTK ``` **** ### Command line examples Images used in the examples below was downloaded from [openslide data](http://openslide.cs.cmu.edu/download/openslide-testdata/), the other data files are in the repository data/ directory. <br> #### Find the patches in a wsi file and write to an image file for preview. ``` python3 -m digipath_mltk.cli -m write_mask_preview_set -i yourpath/images/CMU-1-Small-Region.svs -o results ``` #### Find the patches in a wsi file and write to a directory. ``` python3 -m digipath_mltk.cli -m wsi_to_patches_dir -i CMU-1-Small-Region.svs -o results ``` #### Find the patches in a wsi file and write to a .tfrecords file. ``` python3 -m digipath_mltk.cli -m wsi_to_tfrecord -i CMU-1-Small-Region.svs -o results ``` #### View the patch locations in a .tfrecoreds file. ``` python3 -m digipath_mltk.cli -m tfrecord_to_masked_thumb -i CMU-1-Small-Region.svs -r CMU-1-Small-Region.tfrecords -o results ``` ` ( test data not currently available in DigiPath_MLTK repository for the following examples ) ` #### Find pairs of patches with registration offset in two wsi files and write to a directory. ``` python3 -m digipath_mltk.cli -m registration_to_dir -i wsi_fixed.tiff -f wsi_float.tiff -D wsi_pair_sample_offset.csv -o results ``` #### Find pairs of patches with registration offset in two wsi files and write to a tfrecords file. ``` python3 -m digipath_mltk.cli -m registration_to_tfrecord -i wsi_fixed.tiff -f wsi_float.tiff -D wsi_pair_sample_offset.csv -o results ``` #### Find the patches in a wsi file defined in an annotations file with a priority file and write to a directory. ``` python3 -m digipath_mltk.cli -m annotations_to_dir -i wsi_float.tiff -p wsi_float_annotation.csv -a wsi_float_annotation.xml -o results ``` #### Find the patches in a wsi file defined in an annotations file with a priority file and write to a tfrecords file. ``` python3 -m digipath_mltk.cli -m annotations_to_tfrecord -i wsi_float.tiff -p wsi_float_annotation.csv -a wsi_float_annotation.xml -o results ```

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.5	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl digipath-mltk-0.0.0:

pip install digipath-mltk-0.0.0.whl

نصب پکیج tar.gz digipath-mltk-0.0.0:

pip install digipath-mltk-0.0.0.tar.gz