معرفی شرکت ها
dicompyler-core-0.5.5
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
A library of core radiation therapy modules for DICOM / DICOM RT used by dicompyler
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | dicompyler-core-0.5.5 |
| نام | dicompyler-core |
| نسخه کتابخانه | 0.5.5 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | Aditya Panchal |
| ایمیل نویسنده | apanchal@bastula.org |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/dicompyler/dicompyler-core |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/dicompyler-core/ |
| مجوز | BSD License |
dicompyler-core
===============
|Binder| |pypi| |travis-ci| |coveralls| |Codacy| |Codecov| |Documentation Status| |Zenodo|
A library of core radiation therapy modules for DICOM / DICOM RT used by `dicompyler <http://www.dicompyler.com>`__. This
package includes:
- ``dicomparser``: parse DICOM objects in an easy-to-use manner
- ``dvh``: Pythonic access to dose volume histogram (DVH) data
- ``dvhcalc``: Independent DVH calculation using DICOM RT Dose & RT Structure Set
Other information
-----------------
- Free software: `BSD license <https://github.com/dicompyler/dicompyler-core/blob/master/LICENSE>`__
- Documentation: `Read the docs <https://dicompyler-core.readthedocs.io>`__
- Tested on Python 2.7, 3.5, 3.6
Dependencies
------------
- `numpy <http://www.numpy.org>`__ 1.2 or higher
- `pydicom <https://pydicom.github.io>`__ 0.9.9 or higher (pydicom 1.0 compatible)
- `matplotlib <http://matplotlib.org>`__ 1.3.0 or higher (for DVH calculation)
- `six <https://pythonhosted.org/six/>`__ 1.5 or higher
- Optional:
- `Pillow <https://pillow.readthedocs.io>`__ (for image display)
- `Shapely <https://github.com/Toblerity/Shapely>`__ (for structure volume calculation)
- `scikit-image <http://scikit-image.org/>`__ (for DVH interpolation)
Basic Usage
------------
.. code-block:: python
from dicompylercore import dicomparser, dvh, dvhcalc
dp = dicomparser.DicomParser("rtss.dcm")
# i.e. Get a dict of structure information
structures = dp.GetStructures()
>>> structures[5]
{'color': array([255, 128, 0]), 'type': 'ORGAN', 'id': 5, 'empty': False, 'name': 'Heart'}
# Access DVH data
rtdose = dicomparser.DicomParser("rtdose.dcm")
heartdvh = dvh.DVH.from_dicom_dvh(rtdose.ds, 5)
>>> heartdvh.describe()
Structure: Heart
DVH Type: cumulative, abs dose: Gy, abs volume: cm3
Volume: 437.46 cm3
Max Dose: 3.10 Gy
Min Dose: 0.02 Gy
Mean Dose: 0.64 Gy
D100: 0.00 Gy
D98: 0.03 Gy
D95: 0.03 Gy
D2cc: 2.93 Gy
# Calculate a DVH from DICOM RT data
calcdvh = dvhcalc.get_dvh("rtss.dcm", "rtdose.dcm", 5)
>>> calcdvh.max, calcdvh.min, calcdvh.D2cc
(3.0899999999999999, 0.029999999999999999, dvh.DVHValue(2.96, 'Gy'))
Advanced Usage and Examples can be found in Binder: |Binder|
Citing dicompyler-core
----------------------
A DOI for dicompyler-core with various citation styles can be found at Zenodo: |Zenodo|
Credits
-------
This package was created with
`Cookiecutter <https://github.com/audreyr/cookiecutter>`__ and the
`audreyr/cookiecutter-pypackage <https://github.com/audreyr/cookiecutter-pypackage>`__ project template.
.. |Binder| image:: http://mybinder.org/badge.svg
:target: http://mybinder.org/repo/bastula/dicom-notebooks
.. |pypi| image:: https://img.shields.io/pypi/v/dicompyler-core.svg
:target: https://pypi.python.org/pypi/dicompyler-core
.. |travis-ci| image:: https://img.shields.io/travis/dicompyler/dicompyler-core.svg
:target: https://travis-ci.org/dicompyler/dicompyler-core
.. |coveralls| image:: https://coveralls.io/repos/github/dicompyler/dicompyler-core/badge.svg?branch=master
:target: https://coveralls.io/github/dicompyler/dicompyler-core?branch=master
.. |Codacy| image:: https://api.codacy.com/project/badge/Grade/39060fc468844402a4030715fe01bb15
:target: https://www.codacy.com/app/bastula/dicompyler-core?utm_campaign=Badge_Coverage
.. |Codecov| image:: https://codecov.io/gh/dicompyler/dicompyler-core/branch/master/graph/badge.svg
:target: https://codecov.io/gh/dicompyler/dicompyler-core
.. |Documentation Status| image:: https://readthedocs.org/projects/dicompyler-core/badge/?version=latest
:target: https://dicompyler-core.readthedocs.io/en/latest/
.. |Zenodo| image:: https://zenodo.org/badge/51550203.svg
:target: https://zenodo.org/badge/latestdoi/51550203
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >=1.2 | numpy |
| >=1.5 | six |
| >=0.9.9 | pydicom |
| >=1.3.0 | matplotlib |
| - | scikit-image |
| >=1.0 | pillow |
| >=1.6 | shapely |
نحوه نصب
نصب پکیج whl dicompyler-core-0.5.5:
pip install dicompyler-core-0.5.5.whl
نصب پکیج tar.gz dicompyler-core-0.5.5:
pip install dicompyler-core-0.5.5.tar.gz