معرفی شرکت ها

diamond4py-0.0.5

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.0.5
0.0.3
0.0.2rc3
0.0.2rc2
0.0.2rc1
0.0.1rc1
0.0.5
0.0.3
0.0.2rc3
0.0.2rc2
0.0.2rc1

توضیحات

Diamond Python bindings for sequence alignment
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل diamond4py-0.0.5
نام diamond4py
نسخه کتابخانه 0.0.5
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده -
ایمیل نویسنده "Zhang.H.N" <zhang.h.n@foxmail.com>
آدرس صفحه اصلی -
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/diamond4py/
مجوز GPLv3
# diamond4py [![pypi](https://github.com/GCS-ZHN/diamond4py/actions/workflows/pypi.yml/badge.svg)](https://pypi.org/project/diamond4py/) ![license](https://img.shields.io/badge/license-GPLv3-blue.svg) ![python](https://img.shields.io/badge/python->=3.7-success.svg) This is python binding for [diamond](https://github.com/bbuchfink/diamond)--a sequence alignment BLAST software implements in C++. ## install - from source code ```bash git clone https://github.com/GCS-ZHN/diamond4py.git cd diamond4py conda create -n diamond4py python=3.8 # zlib is required by diamond. conda install -c anaconda zlib pip install -v . ``` - from pypi ```bahs pip install diamond4py ``` ## Usage ```python from diamond4py import Diamond # create a object diamond = Diamond( database="database.dmnd", n_threads=4 ) # make db if you don't create it or just download one from websites diamond.makedb("database.fasta") print(diamond.version) # print database statistic info diamond.dbinfo() # run blast for proteins diamond.blastp( query="test_proteins.fasta", out="test_output" ) ```


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.7 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl diamond4py-0.0.5:

    pip install diamond4py-0.0.5.whl


نصب پکیج tar.gz diamond4py-0.0.5:

    pip install diamond4py-0.0.5.tar.gz