معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Deep Embedded Single-cell RNA-seq Clustering

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	desc-2.1.1
نام	desc
نسخه کتابخانه	2.1.1
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Xiangjie Li, Gang Hu, Mingyao Li, Yafei Lyu
ایمیل نویسنده	ele717@163.com, huggs@nankai.edu.cn, mingyao@pennmedicine.upenn.edu, lyuyafei@gmail.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/eleozzr/desc
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/desc/
مجوز	MIT

DESC is an unsupervised deep learning algorithm for clustering scRNA-seq data. The algorithm constructs a non-linear mapping function from the original scRNA-seq data space to a low-dimensional feature space by iteratively learning cluster-specific gene expression representation and cluster assignment based on a deep neural network. This iterative procedure moves each cell to its nearest cluster, balances biological and technical differences between clusters, and reduces the influence of batch effect. DESC also enables soft clustering by assigning cluster-specific probabilities to each cell, which facilitates the identification of cells clustered with high-confidence and interpretation of results.

نیازمندی

مقدار	نام
>=2.2pydot	matplotlib
-	tensorflow
-	scanpy
-	louvain
-	python-igraph
-	h5py
-	pandas

نحوه نصب

نصب پکیج whl desc-2.1.1:

pip install desc-2.1.1.whl

نصب پکیج tar.gz desc-2.1.1:

pip install desc-2.1.1.tar.gz