معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

A tool to segment dendrites

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	dendritic-arborization-tracer-0.1
نام	dendritic-arborization-tracer
نسخه کتابخانه	0.1
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Benoit Aigouy
ایمیل نویسنده	baigouy@gmail.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/baigouy/DAT
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/dendritic-arborization-tracer/
مجوز	BSD

# Dendritic Arborization Tracer Dendritic Arborization Tracer is a tool to segment neurons along with their dendrites. Ideally, it takes a single channel image as input. - The neuron mask is detected in the 'Mask neuron' tab - The cell body mask is detected in the 'Mask cell body' tab - Finally, the neuron is skeletonized in the 'Segment dendrites' tab using skeletonization or using the watershed algotrithm. Once skeletonized, the neuron can be further segmented to identify dendrites. # Install 1. Install [python 3.7](https://www.python.org/downloads/) or [Anaconda 3.7](https://www.anaconda.com/distribution/) (if not already present on your system) 2. In a command prompt type: ``` pip install --user --upgrade dendritic-arborization-tracer ``` or ``` pip3 install --user --upgrade dendritic-arborization-tracer ``` NB: - To open a **command prompt** on **Windows** press **'Windows'+R** then type **'cmd'** - To open a **command prompt** on **MacOS** press **'Command'+Space** then type in **'Terminal'** 3. To open the graphical user interface, type the following in a command: ``` python -m dendritic_arborization_tracer ``` or ``` python3 -m dendritic_arborization_tracer ```

نیازمندی

مقدار	نام
-	opencv-python
-	czifile
-	matplotlib
-	numpy
-	numpydoc
-	Pillow
-	PyQt5
-	PyQtWebEngine
-	read-lif
-	scikit-image
-	scipy
-	tifffile
-	natsort
-	numexpr

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.6	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl dendritic-arborization-tracer-0.1:

pip install dendritic-arborization-tracer-0.1.whl

نصب پکیج tar.gz dendritic-arborization-tracer-0.1:

pip install dendritic-arborization-tracer-0.1.tar.gz