معرفی شرکت ها


deepsvr-0.0.1.post1


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Automated Somatic Variant Refinement by Deep Learning
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل deepsvr-0.0.1.post1
نام deepsvr
نسخه کتابخانه 0.0.1.post1
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده The Griffith Lab
ایمیل نویسنده obigriffith@wustl.edu
آدرس صفحه اصلی https://github.com/griffithlab/manual_review_classifier/tree/master/deepsvr
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/deepsvr/
مجوز -
Cancer genomic analysis requires accurate identification of somatic variants in sequencing data. Manual review to refine somatic variant calls is required as a final step after automated processing. However, manual variant refinement is time-consuming, costly, poorly standardized, and non-reproducible. Here, we systematized and standardized somatic variant refinement using a machine learning approach. The final model accurately recapitulated manual somatic variant refinement labels using an independent testing set and accurately predicted somatic variants confirmed by orthogonal validation sequencing data. The model improves on manual somatic variant refinement by reducing bias on calls usually subject to high inter-reviewer variability.


نیازمندی

مقدار نام
- click
- convert-zero-one-based
- h5py
- keras
- matplotlib
- numpy
- pandas
- seaborn
- setuptools
- sklearn
- tensorflow


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl deepsvr-0.0.1.post1:

    pip install deepsvr-0.0.1.post1.whl


نصب پکیج tar.gz deepsvr-0.0.1.post1:

    pip install deepsvr-0.0.1.post1.tar.gz