معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Automated Somatic Variant Refinement by Deep Learning

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	deepsvr-0.0.1.post1
نام	deepsvr
نسخه کتابخانه	0.0.1.post1
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	The Griffith Lab
ایمیل نویسنده	obigriffith@wustl.edu
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/griffithlab/manual_review_classifier/tree/master/deepsvr
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/deepsvr/
مجوز	-

Cancer genomic analysis requires accurate identification of somatic variants in sequencing data. Manual review to refine somatic variant calls is required as a final step after automated processing. However, manual variant refinement is time-consuming, costly, poorly standardized, and non-reproducible. Here, we systematized and standardized somatic variant refinement using a machine learning approach. The final model accurately recapitulated manual somatic variant refinement labels using an independent testing set and accurately predicted somatic variants confirmed by orthogonal validation sequencing data. The model improves on manual somatic variant refinement by reducing bias on calls usually subject to high inter-reviewer variability.

نیازمندی

مقدار	نام
-	click
-	convert-zero-one-based
-	h5py
-	keras
-	matplotlib
-	numpy
-	pandas
-	seaborn
-	setuptools
-	sklearn
-	tensorflow

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl deepsvr-0.0.1.post1:

pip install deepsvr-0.0.1.post1.whl

نصب پکیج tar.gz deepsvr-0.0.1.post1:

pip install deepsvr-0.0.1.post1.tar.gz