معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Finds and discards exact duplicate reads in fastq files.

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	dedup_hash-0.1.1
نام	dedup_hash
نسخه کتابخانه	0.1.1
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Marius van den Beek
ایمیل نویسنده	m.vandenbeek@gmail.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/mvdbeek/dedup_hash
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/dedup_hash/
مجوز	MIT

.. image:: https://travis-ci.org/mvdbeek/dedup_hash.svg?branch=master :target: https://travis-ci.org/mvdbeek/dedup_hash dedup_hash ---------------------------- This is a commandline utility to remove exact duplicate reads from paired-end fastq files. Reads are assumed to be in 2 separate files. Read sequences are then concatenated and a short hash is calculated on the concatenated sequence. If the hash has been previsouly seen the read will be dropped from the output file. This means that reads that have the same start and end coordinate, but differ in lengths will not be removed (but those will be "flattened" to at most 1 occurence). This algorithm is very simple and fast, and saves memory as compared to reading the whole fastq file into memory, such as fastuniq does. Installation ------------ depdup_city relies on the cityhash python package, which supports python-2.7 exclusively. ``pip install dedup_hash`` History ------- .. to_doc --------------------- 0.1.1 (2016-11-23) --------------------- * Make python2/3 compatible * Use smhasher as default hasher and add options for cityhash and hashxx * Testing enhancements * Initial version --------------------- 0.1.0 (2016-11-16) --------------------- * Initial version

نحوه نصب

نصب پکیج whl dedup_hash-0.1.1:

pip install dedup_hash-0.1.1.whl

نصب پکیج tar.gz dedup_hash-0.1.1:

pip install dedup_hash-0.1.1.tar.gz