معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Ensemble of methods to infer biological activities from omics data

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	decoupler-1.3.4
نام	decoupler
نسخه کتابخانه	1.3.4
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Pau Badia i Mompel
ایمیل نویسنده	pau.badia@uni-heidelberg.de
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/saezlab/decoupler-py
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/decoupler/
مجوز	-

# decoupler - Ensemble of methods to infer biological activities <img src="https://github.com/saezlab/decoupleR/blob/master/inst/figures/logo.svg?raw=1" align="right" width="120" class="no-scaled-link" />  [![main](https://github.com/saezlab/decoupler-py/actions/workflows/main.yml/badge.svg)](https://github.com/saezlab/decoupler-py/actions) [![GitHub issues](https://img.shields.io/github/issues/saezlab/decoupler-py.svg)](https://github.com/saezlab/decoupler-py/issues/) [![Downloads](https://pepy.tech/badge/decoupler)](https://pepy.tech/project/decoupler) [![Documentation Status](https://readthedocs.org/projects/decoupler-py/badge/?version=latest)](https://decoupler-py.readthedocs.io/en/latest/?badge=latest) [![codecov](https://codecov.io/gh/saezlab/decoupler-py/branch/main/graph/badge.svg?token=TM0P29KKN5)](https://codecov.io/gh/saezlab/decoupler-py)  **decoupler** is a package containing different statistical methods to extract biological activities from omics data within a unified framework. This is its faster and memory efficient Python implementation, for the R version go [here](https://github.com/saezlab/decoupleR). For further information and example tutorials, please check our [documentation](https://decoupler-py.readthedocs.io/en/latest/index.html). If you have any question or problem do not hesitate to open an [issue](https://github.com/saezlab/decoupler-py/issues). ## Installation To install the latest stable version run: ``` pip install decoupler ``` Alternatively, to stay up-to-date with the newest version, run: ``` pip install git+https://github.com/saezlab/decoupler-py.git ``` ## scverse **decoupler** is part of the [scverse](https://scverse.org) ecosystem, a collection of tools for single-cell omics data analysis in python. For more information check the link. ## License Footprint methods inside decoupler can be used for academic or commercial purposes, except `viper` which holds a non-commercial license. The data redistributed by OmniPath does not have a license, each original resource carries their own. [Here](https://omnipathdb.org/info) one can find the license information of all the resources in OmniPath. ## Citation Badia-i-Mompel P., Vélez Santiago J., Braunger J., Geiss C., Dimitrov D., Müller-Dott S., Taus P., Dugourd A., Holland C.H., Ramirez Flores R.O. and Saez-Rodriguez J. 2022. decoupleR: Ensemble of computational methods to infer biological activities from omics data. Bioinformatics Advances. <https://doi.org/10.1093/bioadv/vbac016>

نیازمندی

مقدار	نام
-	numba
-	tqdm
-	anndata
-	typing-extensions

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.6	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl decoupler-1.3.4:

pip install decoupler-1.3.4.whl

نصب پکیج tar.gz decoupler-1.3.4:

pip install decoupler-1.3.4.tar.gz