معرفی شرکت ها


debayer-ohweier-0.0.1


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Small toolkit to debayer and stack images.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل debayer-ohweier-0.0.1
نام debayer-ohweier
نسخه کتابخانه 0.0.1
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Jan Paschen
ایمیل نویسنده jan@ej-paschen.de
آدرس صفحه اصلی -
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/debayer-ohweier/
مجوز -
# Debayer Ohweier Small toolkit to debayer and stack images. ## How to capture images Use the setting (Bayer) for taking the images. ![](micromanager_gui.png) # Example ```python from debayer_ohweier import debayer,get_gradient_stack,get_argmax, zstack,save_image,save_plot import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np import os import glob path='sample data' #Path to the tif-files from Microscope im_paths=sorted(glob.glob(os.path.join(path,'*.tif'))) # load and debayer all files ims=[] for p in im_paths: im=debayer(path=p) ims.append(im) dirname,filename=os.path.split(p) save_image(im,os.path.join(dirname,'debayered',filename)) print('debayered') # calc the gradient of all images. the gradient is highest for sharb edges in the image, hence, areas in Focus a_grad_stack,a_grad_b_stack=get_gradient_stack(ims) print('gradient') # chose the image with the higest gradient per location to get height information a_max_b=get_argmax(a_grad_b_stack) a_max=get_argmax(a_grad_stack) save_image(a_max,os.path.join(path,'stack','height.tif')) save_plot(a_max,os.path.join(path,'stack','height.pdf'),pixelsize=800/60,s_unit='$\mu m$') save_plot(a_max,os.path.join(path,'stack','height.svg'),pixelsize=800/60,s_unit='$\mu m$') save_plot(a_max,os.path.join(path,'stack','height.png'),pixelsize=800/60,s_unit='$\mu m$') print('argmax') # Stack debayered images acording to height information a_neu=zstack(ims,a_max_b,blur=True, blursize=30) save_image(a_neu,os.path.join(path,'stack','stack.tif')) save_image(a_neu,os.path.join(path,'stack','stack.jpg')) print('zstack') ``` Developer: Jan Paschen <br> jan.paschen@ise.fraunhofer.de


نیازمندی

مقدار نام
- matplotlib
- numpy
- opencv-python


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.6 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl debayer-ohweier-0.0.1:

    pip install debayer-ohweier-0.0.1.whl


نصب پکیج tar.gz debayer-ohweier-0.0.1:

    pip install debayer-ohweier-0.0.1.tar.gz