معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Cyclic ImmunoFluoresence (cycIF) Automatic Analysis Pipeline

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	cycIFAAP-5.7.2
نام	cycIFAAP
نسخه کتابخانه	5.7.2
نگهدارنده	['Guillaume THIBAULT']
ایمیل نگهدارنده	['thibaulg@ohsu.edu']
نویسنده	Guillaume THIBAULT, Erik Burlingame, Young Hwan Chang
ایمیل نویسنده	thibaulg@ohsu.edu, chanyo@ohsu.edu
آدرس صفحه اصلی	https://www.thibault.biz/Research/cycIFAAP/cycIFAAP.html
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/cycIFAAP/
مجوز	MIT

# Cyclic ImmunoFluorescence Automatic Analysis Pipeline This pipeline takes as input a set of cyclic immunofluorescence (cycIF) images and performs the following operations: - Registration - Nuclei segmentation (using CellPose or own trained Mask R-CNN model) - Background subtraction - Compute each marker exclusiveness to be used with Restore - Use Restore when possible for automatic gating (optionnal) - Features extraction - Cell type computation - Automatic visualization using Napari - Quality control (tissue loss and Restore based) For installation, more information/details and full examples with code and data, visit: https://www.thibault.biz/Research/cycIFAAP/cycIFAAP.html

نیازمندی

مقدار	نام
>=1.5.1	FiReTiTiPyLib
<2.0,>=1.0.2	cellpose
>=0.12.0	DeepCell
>=1.22.4	numpy
<1.8,>=1.7.1	torch
<0.9,>=0.8.2	torchvision

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.8,<3.10	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl cycIFAAP-5.7.2:

pip install cycIFAAP-5.7.2.whl

نصب پکیج tar.gz cycIFAAP-5.7.2:

pip install cycIFAAP-5.7.2.tar.gz