معرفی شرکت ها


cycIFAAP-5.7.2


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Cyclic ImmunoFluoresence (cycIF) Automatic Analysis Pipeline
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل cycIFAAP-5.7.2
نام cycIFAAP
نسخه کتابخانه 5.7.2
نگهدارنده ['Guillaume THIBAULT']
ایمیل نگهدارنده ['thibaulg@ohsu.edu']
نویسنده Guillaume THIBAULT, Erik Burlingame, Young Hwan Chang
ایمیل نویسنده thibaulg@ohsu.edu, chanyo@ohsu.edu
آدرس صفحه اصلی https://www.thibault.biz/Research/cycIFAAP/cycIFAAP.html
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/cycIFAAP/
مجوز MIT
# Cyclic ImmunoFluorescence Automatic Analysis Pipeline This pipeline takes as input a set of cyclic immunofluorescence (cycIF) images and performs the following operations: - Registration - Nuclei segmentation (using CellPose or own trained Mask R-CNN model) - Background subtraction - Compute each marker exclusiveness to be used with Restore - Use Restore when possible for automatic gating (optionnal) - Features extraction - Cell type computation - Automatic visualization using Napari - Quality control (tissue loss and Restore based) For installation, more information/details and full examples with code and data, visit: https://www.thibault.biz/Research/cycIFAAP/cycIFAAP.html


نیازمندی

مقدار نام
>=1.5.1 FiReTiTiPyLib
<2.0,>=1.0.2 cellpose
>=0.12.0 DeepCell
>=1.22.4 numpy
<1.8,>=1.7.1 torch
<0.9,>=0.8.2 torchvision


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.8,<3.10 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl cycIFAAP-5.7.2:

    pip install cycIFAAP-5.7.2.whl


نصب پکیج tar.gz cycIFAAP-5.7.2:

    pip install cycIFAAP-5.7.2.tar.gz