معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Common workflow language reference implementation patched for UCSC-CGL

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	cwltool-ucsc-1.36.20161114152756
نام	cwltool-ucsc
نسخه کتابخانه	1.36.20161114152756
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Common workflow language working group
ایمیل نویسنده	common-workflow-language@googlegroups.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/tboser/cwltool
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/cwltool-ucsc/
مجوز	Apache 2.0

================================================================== Common workflow language tool description reference implementation ================================================================== CWL Conformance test: |Build Status| This is the reference implementation of the Common Workflow Language. It is intended to be feature complete and provide comprehensive validation of CWL files as well as provide other tools related to working with CWL. This is written and tested for Python 2.7. The reference implementation consists of two packages. The "cwltool" package is the primary Python module containing the reference implementation in the "cwltool" module and console executable by the same name. The "cwlref-runner" package is optional and provides an additional entry point under the alias "cwl-runner", which is the implementation-agnostic name for the default CWL interpreter installed on a host. Install ------- Installing the official package from PyPi (will install "cwltool" package as well):: pip install cwlref-runner If installling alongside another CWL implementation then:: pip instal cwltool To install from source:: git clone https://github.com/common-workflow-language/cwltool.git cd cwltool && python setup.py install cd cwlref-runner && python setup.py install # co-installing? skip this Remember, if co-installing multiple CWL implementations then you need to maintain which implementation ``cwl-runner`` points to via a symbolic file system link or [another facility](https://wiki.debian.org/DebianAlternatives). Run on the command line ----------------------- Simple command:: cwl-runner [tool-or-workflow-description] [input-job-settings] Or if you have multiple CWL implementations installed and you want to override the default cwl-runner use:: cwltool [tool-or-workflow-description] [input-job-settings] Import as a module ---------------- Add:: import cwltool to your script. Use with boot2docker -------------------- boot2docker is running docker inside a virtual machine and it only mounts ``Users`` on it. The default behavoir of CWL is to create temporary directories under e.g. ``/Var`` which is not accessible to Docker containers. To run CWL successfully with boot2docker you need to set the ``--tmpdir-prefix`` and ``--tmp-outdir-prefix`` to somewhere under ``/Users``:: $ cwl-runner --tmp-outdir-prefix=/Users/username/project --tmpdir-prefix=/Users/username/project wc-tool.cwl wc-job.json .. |Build Status| image:: https://ci.commonwl.org/buildStatus/icon?job=cwltool-conformance :target: https://ci.commonwl.org/job/cwltool-conformance/ Tool or workflow loading from remote or local locations ------------------------------------------------------- ``cwltool`` can run tool and workflow descriptions on both local and remote systems via its support for HTTP[S] URLs. Input job files and Workflow steps (via the `run` directive) can reference CWL documents using absolute or relative local filesytem paths. If a relative path is referenced and that document isn't found in the current directory then the following locations will be searched: http://www.commonwl.org/v1.0/CommandLineTool.html#Discovering_CWL_documents_on_a_local_filesystem

نحوه نصب

نصب پکیج whl cwltool-ucsc-1.36.20161114152756:

pip install cwltool-ucsc-1.36.20161114152756.whl

نصب پکیج tar.gz cwltool-ucsc-1.36.20161114152756:

pip install cwltool-ucsc-1.36.20161114152756.tar.gz