معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Common workflow language reference implementation backended by a GA4GH Task Execution Service

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	cwl-tes-0.3.0
نام	cwl-tes
نسخه کتابخانه	0.3.0
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Adam Struck
ایمیل نویسنده	strucka@ohsu.edu
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/common-workflow-language/cwl-tes
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/cwl-tes/
مجوز	Apache 2.0

[![Build Status](https://travis-ci.org/ohsu-comp-bio/cwl-tes.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/ohsu-comp-bio/cwl-tes) [![License](https://img.shields.io/badge/License-Apache%202.0-blue.svg)](https://opensource.org/licenses/Apache-2.0) # GA4GH CWL Task Execution ___cwl-tes___ submits your tasks to a TES server. Task submission is parallelized when possible. [Funnel](https://ohsu-comp-bio.github.io/funnel) is an implementation of the [GA4GH task execution API](https://github.com/ga4gh/task-execution-schemas). It runs your dockerized tasks on slurm, htcondor, google compute engine, aws batch, etc. ## Requirements * Python 2.7 / 3.5 / 3.6 * [Docker](https://docs.docker.com/) * [Funnel](https://ohsu-comp-bio.github.io/funnel) ## Quickstart * Start the task server ``` funnel server run ``` * Run your CWL tool/workflow ``` cwl-tes --tes http://localhost:8000 tests/hashsplitter-workflow.cwl.yml --input tests/resources/test.txt ``` ## Install I strongly recommend using a [virtualenv](https://virtualenv.pypa.io/en/stable/#) for installation since _cwl-tes_ depends on a specific version of _cwltool_. Install from pip: ``` pip install cwl-tes ``` Install from source: ``` python setup.py install ``` ## Run the v1.0 conformance tests To start a funnel server instance automatically and run all of the tests, install [tox](https://github.com/tox-dev/tox/) and run it ``` $ pip install tox $ tox ``` For running only the conformance tests in python 2.7: ``` $ tox -e py27-unit ``` In a similar way they can be run on any supported python interpreter. _A more manual approach:_ Download the conformance tests: ``` git submodule update --init --recursive ``` Start the funnel server. ``` funnel server --config /path/to/config.yaml ``` Make sure that TMPDIR is specified in the AllowedDirs of your Local storage configuration. To run all the tests: ``` ./tests/run_conformance.sh ``` To run a specifc test: ``` ./tests/run_conformance.sh 10 ```

نیازمندی

مقدار	نام
==1.0.20191022103248	cwltool
>=0.16.0	future
>=0.4.0	py-tes
>=1.6.4	PyJWT
>=2.14.2	requests
>=3.7.4	typing-extensions
>=1.0.20190228134645	cwltest
>=1.3.7	nose
>=3.7.0	flake8
>=3.12	PyYAML

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=2.7, !=3.0., !=3.1., !=3.2., !=3.3., !=3.4.*, <4	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl cwl-tes-0.3.0:

pip install cwl-tes-0.3.0.whl

نصب پکیج tar.gz cwl-tes-0.3.0:

pip install cwl-tes-0.3.0.tar.gz