معرفی شرکت ها
covid-util-0.0.8
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
CLI tool for uploading data to the European COVID-19 data platform backed up by Embassy S3
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | covid-util-0.0.8 |
| نام | covid-util |
| نسخه کتابخانه | 0.0.8 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | biosamples-dev |
| ایمیل نویسنده | biosamples-dev@ebi.ac.uk |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/EBIBioSamples/hca-util |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/covid-util/ |
| مجوز | Apache License |
# covid-util
CLI tool for uploading and downloading files from the EMBL-EBI hosted Embassy cloud infrastructure
PyPi: https://pypi.org/project/covid-util/
# Users
## Prerequisites
Users need to have
1. Basic command-line knowledge
2. Python3.x installed on their machine
3. Credentials to access data in the S3 bucket (access and secret keys)
## Install
Get `covid-util` from PyPi.
```shell script
$ pip install covid-util
```
## Usage
Display help
```shell script
$ covid-util -h
usage: covid-util [-h] [--profile PROFILE]
{config,create,select,dir,clear,list,upload,download,delete}
```
In the above, optional arguments are between `[]` and choices between `{}`.
The basic usage is as follows:
```shell script
$ covid-util cmd ARG1 ARG2 -o1 -o2
```
Use the tool by specifying a command (`cmd` - see list below) to run, any mandatory (positional) arguments (e.g. `ARG1` and `ARG2` - see positional args for each command), and any optional arguments (e.g. `-o1` and `o2` - see options for each command).
## List of commands
help for a specific command:
```shell script
$ covid-util <command> -h
```
Some commands or options/flags are restricted to authorised users (for e.g. wranglers, admin) only.
## `config` command
Configure AWS credentials
```shell script
$ covid-util config ACCESS_KEY SECRET_KEY
positional arguments:
ACCESS_KEY AWS Access Key ID
SECRET_KEY AWS Secret Access Key
```
By default, this tool looks for and uses the profile name _covid-util_embassy, if it exists, or it can be set by the `config` command.
Running a command with the `--profile` argument uses the specified profile instead of the default _covid-util_ profile.
## `create` command
Create an upload area **(authorised users only)**
```shell script
$ covid-util create NAME [-p {u,ud,ux,udx}]
positional arguments:
NAME name for the new area
optional arguments:
-n name optional project name for new area
-p {u,ud,ux,udx} allowed actions (permissions) on new area. u for
upload, x for delete and d for download. Default is ux
```
## `select` command
Select or show the active upload area
```shell script
$ covid-util select AREA
positional arguments:
AREA area uuid. If not present then selected area is shown
```
## `list` command
List contents of selected area
```shell script
$ covid-util list [-b]
optional arguments:
-b list all areas in bucket **(authorised users only)**
```
## `upload` command
Upload files to the selected area
```shell script
$ covid-util upload (-a | -f file [file ...]) [-o]
optional arguments:
-a upload all files from current user directory
-f file [file ...] upload specified file(s)
-o overwrite files with same names
```
## `download` command
Download files from the selected area
```shell script
$ covid-util download (-a | -f file [file ...])
optional arguments:
-a download all files from selected area
-f file [file ...] download specified file(s) only
```
## `delete` command
Delete files from the selected area
```shell script
$ covid-util delete (-a | -f file [file ...] | -d)
optional arguments:
-a delete all files from selected area
-f file [file ...] delete specified file(s) only
-d delete area and contents **(authorised users only)**
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| ==1.12.* | boto3 |
| ==1.15.* | botocore |
نحوه نصب
نصب پکیج whl covid-util-0.0.8:
pip install covid-util-0.0.8.whl
نصب پکیج tar.gz covid-util-0.0.8:
pip install covid-util-0.0.8.tar.gz