معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Converts and organises source MR image data-sets in accordance with the Brain Imaging Data Structure (BIDS)

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	convert-source-0.2.0a9
نام	convert-source
نسخه کتابخانه	0.2.0a9
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Adebayo Braimah
ایمیل نویسنده	adebayo.braimah@cchmc.org
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/AdebayoBraimah/convert_source
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/convert-source/
مجوز	GPL-3.0 License

[![CircleCI](https://circleci.com/gh/AdebayoBraimah/convert_source.svg?style=svg)](https://app.circleci.com/pipelines/github/AdebayoBraimah/convert_source) [![Documentation Status](https://readthedocs.org/projects/convert-source/badge/?version=latest)](https://convert-source.readthedocs.io/en/latest/) # convert_source Convert source `DICOM`, `PAR REC` or `NIFTI` image data to BIDS directory layout. The YAML configuration file used as input dictates the search terms used to find and rename files. Please see `config/config.default.yml` or `config/config.example.yml` for examples. Requires `dcm2niix` and `pydicom`. ``` usage: study_proc [-h] [-s STUDY_DIR] [-o OUT_DIR] [-c CONFIG.yml] [--no-gzip] [--compress INT] [--zero-pad INT] [--append-dwi-info] [--verbose] [--version] [--path-env PATH_VAR] Convert source data of a study's imaging data to BIDS NIFTI data. optional arguments: -h, --help show this help message and exit Required Argument(s): -s STUDY_DIR, -study STUDY_DIR, --study-dir STUDY_DIR Parent study image directory for all subjects. -o OUT_DIR, -out OUT_DIR, --out-dir OUT_DIR Output directory. Optional Argument(s): -c CONFIG.yml, -config CONFIG.yml, --config-file CONFIG.yml Input YAML configuration file. If no configuration file is provided, then the default configuration file is used. --no-gzip DO NOT gzip the resulting BIDS NIFTI files [default: False]. --compress INT Compression level [1 - 9] - 1 is fastest, 9 is smallest [default: 6]. --zero-pad INT The amount of zeropadding to pad the run numbers of the BIDS NIFTI files (e.g. '--zero-pad=2' corresponds to '01') [default: 2]. --append-dwi-info RECOMMENDED: Appends DWI acquisition information (unique non-zero b-values, and TE, in msec.) to BIDS acquisition filename of diffusion weighted image files [default: False]. --verbose Enables verbose output to the command line. --version Prints the version of 'convert_source', then exits. Expert Option(s): --path-env PATH_VAR Environmental path variable or variables for dependencies (e.g. the path to 'dcm2niix'). NOTE: This option is repeatable, and can thus be specified multiple times. ```

نیازمندی

مقدار	نام
>=1.18.5	numpy
>=2.1.2	pydicom
>=3.2.1	nibabel
>=5.3.1	PyYAML
>=1.0.5	pandas

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.7	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl convert-source-0.2.0a9:

pip install convert-source-0.2.0a9.whl

نصب پکیج tar.gz convert-source-0.2.0a9:

pip install convert-source-0.2.0a9.tar.gz