معرفی شرکت ها
conib-0.0.8
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Curation of Neurodegeneration in BEL (CONIB)
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | conib-0.0.8 |
| نام | conib |
| نسخه کتابخانه | 0.0.8 |
| نگهدارنده | ['Charles Tapley Hoyt'] |
| ایمیل نگهدارنده | ['cthoyt@gmail.com'] |
| نویسنده | Charles Tapley Hoyt |
| ایمیل نویسنده | cthoyt@gmail.com |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/pharmacome/conib |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/conib/ |
| مجوز | MIT License |
<p align="center">
<img src="https://docs.google.com/drawings/d/e/2PACX-1vSYe8SA8J1ulLRFqFjX2bne_L-5fxb-yHFcj1B2JYLksJS90qz8y2swPZPNSrw9Zj3tljrZikb5KWOg/pub?w=150&h=150" />
</p>
<h1 align="center">
Curation of Neurodegeneration in BEL (CONIB)
<a href="https://travis-ci.com/pharmacome/conib">
<img src="https://travis-ci.com/pharmacome/conib.svg?branch=master"
alt="Travis CI">
</a>
<a href="https://zenodo.org/badge/latestdoi/159803376">
<img src="https://zenodo.org/badge/159803376.svg" alt="DOI">
</a>
<br>
</h1>
<p align="center">
This knowledge repository, developed during the <a href="https://pharmacome.github.io">Human Brain Pharmacome project</a>, contains documents in Biological Expression Language (BEL) describing neurodegenerative disease phenomena such as tauopathies.
</p>
<p align="center">
<a href="#installation">Installation</a> •
<a href="#usage">Usage</a> •
<a href="#contributing">Contributing</a> •
<a href="#license">License</a>
</p>
## Content
- [conib](https://github.com/pharmacome/conib/tree/master/conib): This folder contains curated BEL
documents. Most have been organized by category (protein of interest, biological process of interest, pathway, etc.).
Almost BEL documents correspond to a single publication, but a select few contain content from several due to
topic-based curation.
- [docs](https://github.com/pharmacome/conib/tree/master/docs): This folder contains automatically generated HTML
summaries of the content that can best be accesed through https://pharmacome.github.io/conib.
- [notebooks](https://github.com/pharmacome/conib/tree/master/notebooks): This folder contains various Jupyter
notebooks associated with the repository. Since many of them use PyBEL-Jupyter, they may be best viewed using
[NBViewer](https://nbviewer.jupyter.org/github/pharmacome/conib/tree/master/notebooks/).
### Curation Planning
Here are a few links for navigating the GitHub issues and pull requests:
- [Pull requests for curation](https://github.com/pharmacome/conib/pulls?q=is%3Apr+is%3Aopen+label%3ACuration)
- [Pull requests for recuration approved by a reviewer](https://github.com/pharmacome/conib/pulls?q=is%3Apr+is%3Aopen+review%3Aapproved+label%3ARecuration)
## Installation
``conib`` can be installed from [PyPI](https://pypi.org/project/hbp-knowledge/) with the following command:
```bash
$ pip install conib
```
or the latest version can be installed from [GitHub](https://github.com/pharmacome/conib) with:
```bash
$ pip install git+https://github.com/pharmacome/conib.git
```
## Usage
The graph can be loaded with:
```python
import conib
# Get a dictionary of names to graphs
graphs = conib.get_graphs()
# Get all BEL documents as a single graph
graph = conib.get_graph()
# Get all knowledge as INDRA statements
stmts = conib.get_indra_statements()
```
## Contributing
Contributions are welcome! Please submit all pull requests to https://github.com/pharmacome/conib.
## License
- BEL scripts in this repository are licensed under the CC0 1.0 Universal.
- Python source code in this repository is licensed under the MIT license.
## More BEL Content
See [A Listing of Publicly Available Content in the Biological Expression Language (BEL)](https://cthoyt.com/2020/04/30/public-bel-content.html)
on Charles Tapley Hoyt's blog for more BEL content.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >=0.15.0 | pybel |
زبان مورد نیاز
| مقدار | نام |
|---|---|
| >=3.6 | Python |
نحوه نصب
نصب پکیج whl conib-0.0.8:
pip install conib-0.0.8.whl
نصب پکیج tar.gz conib-0.0.8:
pip install conib-0.0.8.tar.gz