معرفی شرکت ها

comut-0.0.3

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.0.3
0.0.2
0.0.1
0.0.3
0.0.2
0.0.1

توضیحات

A Python library for creating comutation plots to visualize genomic and phenotypic information
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل comut-0.0.3
نام comut
نسخه کتابخانه 0.0.3
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Jett Crowdis
ایمیل نویسنده jcrowdis@broadinstitute.org
آدرس صفحه اصلی https://github.com/vanallenlab/comut
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/comut/
مجوز MIT
# CoMut CoMut is a Python library for creating comutation plots to visualize genomic and phenotypic information. ![melanoma_comut](https://raw.githubusercontent.com/vanallenlab/comut/master/examples/images/melanoma_comut.png) ## Installation CoMut can be installed via `pip` `pip install comut` ## Colab Quickstart For those who do not want to install Python or other packages, there is a [Google Colab notebook](https://colab.research.google.com/github/vanallenlab/comut/blob/master/examples/quickstart.ipynb) where you can simply upload a [MAF](https://software.broadinstitute.org/software/igv/MutationAnnotationFormat) file and run the notebook to make a basic comut. This file is also available as a [jupyter notebook](https://github.com/vanallenlab/comut/blob/master/examples/quickstart.ipynb) for local use. ## Citation CoMut is now available on biorxiv https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.18.997361v1. If you use CoMut in a paper, please cite: > Crowdis, J., He, M.X., Reardon, B., Van Allen, E.M. (2020). CoMut: Visualizing integrated molecular information with comutation plots. bioRxiv doi: 10.1101/2020.03.18.997361v1 ## Documentation There is also a [Documentation notebook](https://github.com/vanallenlab/comut/blob/master/examples/documentation.ipynb) that provides documentation for CoMut. It describes the fundamentals of creating comuts and provides the code used to generate the comut above. ## Development If you would like to report a bug or request a feature, please do so using the [issues page](https://github.com/vanallenlab/comut/issues) ## Dependencies CoMut runs on python 3.6 or later. CoMut requires the following packages as dependencies (they will be installed along with CoMut if using `pip`) ``` numpy>=1.18.1 pandas>=0.25.3 palettable>=3.3.0 matplotlib>=3.3.1 ``` ## Versions 0.0.3 - No code is changed, description updated for public release 0.0.2 - Introduce compatability for Python 3.6 0.0.1 - Initial release


نیازمندی

مقدار نام
>=1.18.1 numpy
>=0.25.3 pandas
>=3.3.0 palettable
>=3.1.1 matplotlib


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.6 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl comut-0.0.3:

    pip install comut-0.0.3.whl


نصب پکیج tar.gz comut-0.0.3:

    pip install comut-0.0.3.tar.gz