معرفی شرکت ها
compay-syntax-0.4.1
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Syntax - the arrangement of whole-slide-images and their image tiles to create well-formed computational pathology pipelines.
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | compay-syntax-0.4.1 |
| نام | compay-syntax |
| نسخه کتابخانه | 0.4.1 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | Jevgenij Gamper & Peter Byfield |
| ایمیل نویسنده | jevgenij.gamper5@gmail.com |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/jgamper/compay-syntax |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/compay-syntax/ |
| مجوز | - |
<p align="center">
<br>
<img src="https://raw.githubusercontent.com/jgamper/compay-syntax/master/docs/source/imgs/syntax_logo_text.png?token=ADDZO4PH6CJSK5XTSC2ZLXK6ZPXRY" width="600"/>
<br>
<p>
<p align="center">
<a href="https://github.com/jgamper/compay-syntax/blob/master/LICENSE">
<img alt="GitHub" src="https://img.shields.io/github/license/jgamper/compay-syntax.svg?color=blue">
</a>
<a href="https://jgamper.github.io/compay-syntax/">
<img alt="Documentation" src="https://img.shields.io/website/http/jgamper.github.io/syntax.svg?down_color=red&down_message=offline&up_message=online">
</a>
<a href="https://github.com/jgamper/compay-syntax/releases">
<img alt="GitHub release" src="https://img.shields.io/github/v/release/jgamper/compay-syntax?include_prereleases">
</a>
</p>
# Help building our code and community!
[](https://sourcerer.io/fame/jgamper/jgamper/compay-syntax/links/0)[](https://sourcerer.io/fame/jgamper/jgamper/compay-syntax/links/1)[](https://sourcerer.io/fame/jgamper/jgamper/compay-syntax/links/2)[](https://sourcerer.io/fame/jgamper/jgamper/compay-syntax/links/3)[](https://sourcerer.io/fame/jgamper/jgamper/compay-syntax/links/4)[](https://sourcerer.io/fame/jgamper/jgamper/compay-syntax/links/5)[](https://sourcerer.io/fame/jgamper/jgamper/compay-syntax/links/6)[](https://sourcerer.io/fame/jgamper/jgamper/compay-syntax/links/7)
* All contributions are welcome! Please raise an issue for a bug, feature or pull request!
* <a href="https://twitter.com/share?" class="twitter-share-button" data-text="Check out compay-syntax for custom computational pathology pipelines! " data-url="https://github.com/jgamper/compay-syntax" data-show-count="false">Tweet</a> about this repo!
* Give this repo a star! :star:
<p align="center">
<img src="https://raw.githubusercontent.com/jgamper/compay-syntax/master/docs/source/imgs/star_syntax.png?token=ADDZO4PH6CJSK5XTSC2ZLXK6ZPXRY" width="600"/>
<p>
# Quick Start
### Tissue mask and tiling pipeline
```python
from syntax.slide import Slide
from syntax.transformers.tissue_mask import OtsuTissueMask
from syntax.transformers.tiling import SimpleTiling
from syntax.transformers import Pipeline, visualize_pipeline_results
slide = Slide(slide_path=slide_path)
pipeline = Pipeline([OtsuTissueMask(), SimpleTiling(magnification=40,
tile_size=224,
max_per_class=10)])
slide = pipeline.fit_transform(slide)
visualize_pipeline_results(slide=slide,
transformer_list=pipeline.transformers,
title_list=['Tissue Mask', 'Random Tile Sampling'])
```
<p align="center">
<img src="https://raw.githubusercontent.com/jgamper/compay-syntax/master/docs/source/imgs/simple_pipeline.png?token=ADDZO4ISOOTTRG4MMPNYCXS6ZPXPS" width="600"/>
<p>
# Install
`pip install compay-syntax==0.4.0`
You will need to install openslide. This is included in the dependencies so may be automatically installed. If not I found this to help:
```bash
#!/bin/bash
sudo apt-get install openslide-tools
pip install openslide-python
```
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | numpy |
| - | openslide-python |
| - | matplotlib |
| - | jupyter-client |
| - | jupyter-core |
| - | Pillow |
| - | typeguard |
| - | pandas |
| - | scikit-image |
نحوه نصب
نصب پکیج whl compay-syntax-0.4.1:
pip install compay-syntax-0.4.1.whl
نصب پکیج tar.gz compay-syntax-0.4.1:
pip install compay-syntax-0.4.1.tar.gz