معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

codon usage bias analysis tools

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	codon-bias-0.3.0
نام	codon-bias
نسخه کتابخانه	0.3.0
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Alon Diament
ایمیل نویسنده	dev@alondmnt.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/alondmnt/codon-bias
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/codon-bias/
مجوز	MIT

# codon-bias This package provides codon usage bias (CUB) analysis tools for genomic sequences, focusing on protein coding regions, translation efficiency and synonymous mutations. These include implementations of popular models from the past four decades of codon usage study, such as: - Nucleotide and codon k-mer statistics (GC, GC3, CpG, etc.) - Frequency of Optimal Codons (FOP) - Relative Synonymous Codon Usage (RSCU) - Codon Adaptation Index (CAI), including extensions: - Codon pair (and k-mers) adaptation - Effective Number of Codons (ENC), including extensions: - Background correction - Improved estimation - Effective number of codon pairs (and k-mers) (ENcp) - tRNA Adaptation Index (tAI) - Codon Pair Bias (CPB/CPS) - Relative Codon Bias Score (RCBS) - Normalized Translational Efficiency (nTE) - Directional Codon Bias Score (DCBS) - Codon Usage Frequency Similarity (CUFS) This package also includes tools for sequence optimization based on these codon usage models, and generators of random sequence permutations that can be used to compute empirical p-values and z-scores. ## installation ``` pip install codon-bias ``` ## documentation Read on [Read the Docs](https://codon-bias.readthedocs.org). ## contributing Contributions of additional models to the package are welcome! Please familiarize yourself with the existing classes, and try to conform to their style.

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl codon-bias-0.3.0:

pip install codon-bias-0.3.0.whl

نصب پکیج tar.gz codon-bias-0.3.0:

pip install codon-bias-0.3.0.tar.gz