معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

covarying neighborhood analysis

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	cna-0.1.4
نام	cna
نسخه کتابخانه	0.1.4
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Yakir Reshef, Laurie Rumker
ایمیل نویسنده	yreshef@broadinstitute.org, lrumker@broadinstitute.org
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/immunogenomics/cna
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/cna/
مجوز	-

# cna Covarying neighborhood analysis is a method for finding structure in- and conducting association analysis with multi-sample single-cell datasets. `cna` does not require a pre-specified transcriptional structure such as a clustering of the cells in the dataset. It aims instead to flexibly identify differences of all kinds between samples. `cna` is fast, does not require parameter tuning, produces measures of statistical significance for its association analyses, and allows for covariate correction. `cna` is built on top of `scanpy` and offers a `scanpy`-like interface for ease of use. ## installation To use `cna`, you can either install it directly from the [Python Package Index](https://pypi.org/) by running, e.g., `pip install cna` or if you'd like to manipulate the source code you can clone this repository and add it to your `PYTHONPATH`. ## demo Take a look at our [tutorial](https://nbviewer.jupyter.org/github/yakirr/cna/blob/master/demo/demo.ipynb) to see how to get started with a small synthetic data set. ## citation If you use `cna`, please cite [\[Reshef, Rumker\], et al., Axes of inter-sample variability among transcriptional neighborhoods reveal disease-associated cell states in single-cell data. BioRxiv, 2021](https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.04.19.440534v1). \[...\] contributed equally

نیازمندی

مقدار	نام
>='0.0.4'	multianndata
>='0.7.1'	anndata
>='1.18.1'	numpy
>='1.0.3'	pandas
>='1.4.1'	scipy
>='1.1'	argparse
>='3.1.3'	matplotlib
>='1.4.4.post1'	scanpy

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.6	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl cna-0.1.4:

pip install cna-0.1.4.whl

نصب پکیج tar.gz cna-0.1.4:

pip install cna-0.1.4.tar.gz