معرفی شرکت ها

circadian-0.0.4

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.0.4
0.0.3
0.0.2
0.0.1
0.0.4
0.0.3
0.0.2
0.0.1

توضیحات

Tools for the simulation and analysis of circadian rhythms
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل circadian-0.0.4
نام circadian
نسخه کتابخانه 0.0.4
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Kevin Hannay
ایمیل نویسنده 13168556+khannay@users.noreply.github.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/khannay/circadian
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/circadian/
مجوز Apache Software License 2.0
Circadian ================ true <!-- WARNING: THIS FILE WAS AUTOGENERATED! DO NOT EDIT! --> ## Install ``` sh pip install circadian ``` ## Quick start The below shows how to simulate a shift worker schedule for three models and make an actogram plot ``` python from circadian.plots import Actogram from circadian.models import * from circadian.lights import Light import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np days_night = 3 days_day = 2 slam_shift = Light.ShiftWorkLight(lux = 300.0, dayson=days_night, daysoff=days_day) ts = np.arange(0, 24*30,0.10) light_values = slam_shift(ts, repeat_period=24*(days_night+days_day)) f_model = Forger99Model() spm_model = Hannay19() tpm_model = Hannay19TP() kj_model = KronauerJewett() initial_conditions_forger = f_model.initial_conditions_loop(ts, light_est=light_values, num_loops=1) initial_conditions_kj = kj_model.initial_conditions_loop(ts, light_est=light_values, num_loops=1) initial_conditions_spm = spm_model.initial_conditions_loop(ts, light_est=light_values, num_loops=1) initial_conditions_tpm = tpm_model.initial_conditions_loop(ts, light_est=light_values, num_loops=1) ``` Integrate the models using a explicit RK4 scheme ``` python trajectory = f_model(ts=ts, light_est=light_values, state = initial_conditions_forger) trajectory_kj = kj_model(ts=ts, light_est=light_values, state = initial_conditions_kj) trajectory_spm = spm_model(ts=ts, light_est=light_values, state = initial_conditions_spm) trajectory_tpm = tpm_model(ts=ts, light_est=light_values, state = initial_conditions_tpm) ``` Find the dlmos (Dim Light Melatonin Onset) a experimental measurement of circadian phase ``` python dlmo_f = f_model.dlmos(trajectory) dlmo_kj = kj_model.dlmos(trajectory) dlmo_spm = spm_model.dlmos(trajectory_spm) dlmo_tpm = tpm_model.dlmos(trajectory_tpm) ``` Now let’s make an actogram plot of the light schedule with the DLMOs shown for the simulated shiftworker ``` python acto = Actogram(ts, light_vals=light_values, opacity=1.0, smooth=False) acto.plot_phasemarker(dlmo_f, color='blue', label= "DLMO Forger99") acto.plot_phasemarker(dlmo_spm, color='darkgreen', label = "DLMO SPM") acto.plot_phasemarker(dlmo_tpm, color='red', label = "DLMO TPM" ) acto.plot_phasemarker(dlmo_kj, color='purple', label = "DLMO TPM" ) plt.title("Actogram for a Simulated Shift Worker") plt.tight_layout() plt.show() ``` ![](index_files/figure-commonmark/cell-5-output-1.png)


نیازمندی

مقدار نام
- fastcore
- pandas
- numpy
- scipy
- matplotlib
- torch
- numba
- pytz
- jsonschema


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.7 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl circadian-0.0.4:

    pip install circadian-0.0.4.whl


نصب پکیج tar.gz circadian-0.0.4:

    pip install circadian-0.0.4.tar.gz