معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

A python script to parallelize basic MolVS functions

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	chemosanitizer-0.0.2
نام	chemosanitizer
نسخه کتابخانه	0.0.2
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Pierre-Marie Allard
ایمیل نویسنده	pierre-marie.allard@unige.ch
آدرس صفحه اصلی	https://gitlab.unige.ch/Pierre-Marie.Allard/chemo_sanitizer.git
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/chemosanitizer/
مجوز	MIT

# chemo_sanitizer A set of script using RDKit and MolVS to proceed to the standardization , sanitization and different format conversion. Parallelized. In this state it take only InChI as inputs and returns sanitized SMILES, InChI, InChIKeys, Short InChIkeys, MolecularFormula, ExactMass and XLogP. ## Requirements Install the conda environment by `conda env create -f environment.yml` ### Specific requirement Note that some modules of MolVS are not loaded by default. You will need to edit the MolVS __init__.py in ~/opt/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/molvs/ accordingly. Add these lines to the __init__.py ``` from .fragment import LargestFragmentChooser, FragmentRemover from .charge import Uncharger ``` ## Usage Go to the src folder Then add input and output file path as first and second argument, InChI column header as third argument and finally the number of cpus you want to use. Example : ``` cd src python chemosanitizer.py ~/translatedStructureRdkit.tsv ./test.tsv structureTranslated 6 ```

نحوه نصب

نصب پکیج whl chemosanitizer-0.0.2:

pip install chemosanitizer-0.0.2.whl

نصب پکیج tar.gz chemosanitizer-0.0.2:

pip install chemosanitizer-0.0.2.tar.gz