معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

An explainer for Chemprop based on LIME and PathExplain.

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	chemexp-0.2.4
نام	chemexp
نسخه کتابخانه	0.2.4
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Fabien BERNIER
ایمیل نویسنده	fabien.bernier@telecomnancy.net
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/Locust2520/chemexp
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/chemexp/
مجوز	-

# Chemexp A Chemprop explainer based on [LIME](https://github.com/marcotcr/lime) and [PathExplain](https://github.com/suinleelab/path_explain). ![](images/exp_atom_0.png) ![](images/exp_bond_2.png) ## Installation - Make sure your Python version is >= **3.8** - `conda` is required for ChemProp. If it is not installed on your machine, you can take a look at [miniconda](https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html) 1. Install [Chemprop](https://github.com/chemprop/chemprop) 2. Then simply run `pip install chemexp` 3. You're good to go! ## Explanation ### Using Python ```python import chemexp from chemprop.utils import load_checkpoint model = chemexp.ExplanationModel(load_checkpoint("models/fusion_db_1.pt")) exp = model.explain_molecule("COC(=N)Cc1ccccc1") chemexp.exp_to_png(exp, "mol.png") ``` A little more detail is available in [test/test.py](test/test.py). ### Web interface ![](images/screenshot.png) Although you can use this Python module in your scripts, you can also experiment a user-friendly interface. ⚠️ **Warning:** this only works on Linux for the moment *(this is due to the [linux-specific paths](chemexp/server.py#L26) used to save some files, but it can be adapted for Windows or Mac)*. Use the following command to run the web server: ```shell python -m chemexp <path> ``` where `path` is a folder containing chemprop models / checkpoints (.pt files) ## Authors - BELLANGER Clément - [BERNIER Fabien](https://wwwfr.uni.lu/snt/people/fabien_bernier) - MAIGRET Bernard - [NAPOLI Amedeo](https://members.loria.fr/ANapoli/) To cite our work: ``` @mastersthesis{bernier:hal-03371070, TITLE = {{A Study about Explainability and Fairness in Machine Learning and Knowledge Discovery}}, AUTHOR = {Bernier, Fabien}, URL = {https://hal.inria.fr/hal-03371070}, PAGES = {58}, SCHOOL = {{TELECOM Nancy}}, YEAR = {2021}, MONTH = Sep, KEYWORDS = {machine learning ; explainability ; fairness ; antibiotic classification ; machine learning ; explicabilit{\'e} ; fairness ; classification antibiotique}, PDF = {https://hal.inria.fr/hal-03371070/file/M_moire_ing_nieur_Fabien.pdf#chapter.5}, HAL_ID = {hal-03371070}, HAL_VERSION = {v1}, } ```

نحوه نصب

نصب پکیج whl chemexp-0.2.4:

pip install chemexp-0.2.4.whl

نصب پکیج tar.gz chemexp-0.2.4:

pip install chemexp-0.2.4.tar.gz