معرفی شرکت ها

cellshape-helper-0.0.9rc0

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

3D shape analysis using deep learning
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل cellshape-helper-0.0.9rc0
نام cellshape-helper
نسخه کتابخانه 0.0.9rc0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Matt De Vries, Lucas Dent, Adam Tyson
ایمیل نویسنده mattdevries.ai@gmail.com
آدرس صفحه اصلی -
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/cellshape-helper/
مجوز -
[![Project Status: Active – The project has reached a stable, usable state and is being actively developed.](https://www.repostatus.org/badges/latest/active.svg)](https://www.repostatus.org/#active) [![Python Version](https://img.shields.io/pypi/pyversions/cellshape-helper.svg)](https://pypi.org/project/cellshape-helper) [![PyPI](https://img.shields.io/pypi/v/cellshape-helper.svg)](https://pypi.org/project/cellshape-helper) [![Downloads](https://pepy.tech/badge/cellshape-helper)](https://pepy.tech/project/cellshape-helper) [![Wheel](https://img.shields.io/pypi/wheel/cellshape-helper.svg)](https://pypi.org/project/cellshape-helper) [![Development Status](https://img.shields.io/pypi/status/cellshape-helper.svg)](https://github.com/Sentinal4D/cellshape-helper) [![Tests](https://img.shields.io/github/workflow/status/Sentinal4D/cellshape-helper/tests)]( https://github.com/Sentinal4D/cellshape-helper/actions) [![Coverage Status](https://coveralls.io/repos/github/Sentinal4D/cellshape-helper/badge.svg?branch=master)](https://coveralls.io/github/Sentinal4D/cellshape-helper?branch=master) [![Code style: black](https://img.shields.io/badge/code%20style-black-000000.svg)](https://github.com/psf/black) <img src="https://github.com/Sentinal4D/cellshape-helper/blob/main/img/cellshape_helper_logo.png" alt="Cellshape logo by Matt De Vries"> ___ Cellshape-helper provides the ability to convert 3D masks to point clouds. # To install ```bash pip install cellshape-helper ``` # Basic Usage ```python import cellshape_helper as helper PATH_TO_TIF_FILES = "path/to/tif/files/" PATH_TO_SAVE_MESH = "path/to/save/mesh/files/" PATH_TO_SAVE_PC = "path/to/save/pointcloud/files/" NUM_POINTS = 2048 helper.tif_to_pc_directory(PATH_TO_TIF_FILES, PATH_TO_SAVE_MESH, PATH_TO_SAVE_PC, NUM_POINTS) ``` # Parameters - `PATH_TO_TIF_FILES`: str. The path to you binary masks of cells or nuclei. - `PATH_TO_SAVE_MESH`: str. The path where you want to save the mesh objects to. - `PATH_TO_SAVE_PC`: str. The path where you want to save your point clouds to. - `NUM_POINTS`: str. The number of points to sample from the mesh object when creating a point cloud.


نیازمندی

مقدار نام
- torch
- torchvision
- pyntcloud
==1.21 numpy
- matplotlib
- scikit-image
- pandas
- tqdm
- tifffile
- trimesh
- black
- pytest-cov
- pytest
- gitpython
>=5.0.3 coverage
- bump2version
- pre-commit
- flake8


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.7 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl cellshape-helper-0.0.9rc0:

    pip install cellshape-helper-0.0.9rc0.whl


نصب پکیج tar.gz cellshape-helper-0.0.9rc0:

    pip install cellshape-helper-0.0.9rc0.tar.gz