معرفی شرکت ها


cello-classify-2.1.0


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

CellO
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل cello-classify-2.1.0
نام cello-classify
نسخه کتابخانه 2.1.0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Matthew N. Bernstein
ایمیل نویسنده mbernstein@morgridge.org
آدرس صفحه اصلی https://github.com/deweylab/CellO
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/cello-classify/
مجوز MIT License
======================================================= CellO: Cell Ontology-based Classification ======================================================= CellO (Cell Ontology-based classification) is a Python package for performing cell type classification of human RNA-seq data. CellO makes hierarchical predictions against the Cell Ontology (http://www.obofoundry.org/ontology/cl.html). These classifiers were trained on nearly all of the human primary cell, bulk RNA-seq data in the NCBI's Sequence Read Archive. For instructions on installing and running CellO, see the GitHub repository: https://github.com/deweylab/CellO For more details regarding the underlying method, see the paper: Bernstein, M.N., Ma, J., Gleicher, M., Dewey, C.N. (2020). CellO: Comprehensive and hierarchical cell type classification of human cells with the Cell Ontology. iScience, 24(1), 101913. https://doi.org/10.1016/j.isci.2020.101913.


نیازمندی

مقدار نام
>=0.29.17 Cython
>=0.1.6 quadprog
>=1.17.1 numpy
>=0.22.2.post1 scikit-learn
>=1.3.1 scipy
>=0.23.4 pandas
>=0.3.1.1 dill
>=2.10.0 h5py
>=0.7.1 anndata
- matplotlib
- pygraphviz


نحوه نصب


نصب پکیج whl cello-classify-2.1.0:

    pip install cello-classify-2.1.0.whl


نصب پکیج tar.gz cello-classify-2.1.0:

    pip install cello-classify-2.1.0.tar.gz