معرفی شرکت ها


celescope-1.9.0


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Single Cell Analysis Pipelines
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل celescope-1.9.0
نام celescope
نسخه کتابخانه 1.9.0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده zhouyiqi
ایمیل نویسنده zhouyiqi@singleronbio.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/singleron-RD/CeleScope
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/celescope/
مجوز -
# Introduction CeleScope is a collection of bioinfomatics analysis pipelines to process single cell sequencing data generated with Singleron products. These pipelines take paired-end FASTQ files as input and generate output files which can be used for downstream data analysis as well as a summary of QC criteria. # Documentation [Quick start](./docs/quick_start.md) Detailed docs can be found in [manual](./docs/manual.md). # Support Please use the issue tracker for questions and malfunctions. # About CeleScope is currently developed by Singleron Biotechnologies. [www.singleron.bio](https://www.singleron.bio)


نیازمندی

مقدار نام
==3.7 cutadapt
>=0.18.0 pysam
>=1.5.0 scipy
>=1.21.0 numpy
>=2.10 jinja2
>=0.5.0 xopen
>=0.5.3 editdistance
>=0.0 scikit-learn
>=4.14.3 plotly
==0.9.0 plotnine
==3.5.3 matplotlib
- cython
- pytest
- venn
- pyranges
==1.8.2 scanpy
- statsmodels
- leidenalg
- igraph
==1.4.2 pandas
- biopython
- xlwt
==0.7.6 anndata
- kaleido


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.6 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl celescope-1.9.0:

    pip install celescope-1.9.0.whl


نصب پکیج tar.gz celescope-1.9.0:

    pip install celescope-1.9.0.tar.gz