معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Detecting DNA methylation from PacBio CCS reads

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	ccsmeth-0.3.2
نام	ccsmeth
نسخه کتابخانه	0.3.2
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Peng Ni
ایمیل نویسنده	543943952@qq.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/PengNi/ccsmeth
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/ccsmeth/
مجوز	BSD-3-Clause-Clear license

ccsmeth ======== Documentation ------------- v0.3.2 ---------- fix bug (0-pos CG in reverse strand) of call_freqb module add output check at the start of call_mods/call_freqb update aggregate model v0.3.1 ---------- optimize call_mods module add aggregate mode in call_freqb module release a stable call_mods model and a stable call_freqb aggregate model v0.3.0 ---------- add multi-threads support for reading .bam by pysam force mod prob discrete integer in [0, 255], which means mod prob in [0, 1), in ML tag fix align_hifi module, enable minimap2 and bwa update requirements v0.2.3 ---------- more options in train module multi-gpu support in call_mods and trainm modules add denoise module Note: skip 0.2.2, cause 0.2.2 has been deleted in pypi (https://pypi.org/manage/project/ccsmeth/history/) v0.2.1 ---------- minor fixes change default mode in extract module improvements in call_freqb module v0.2.0 ---------- use hifi reads instead of subreads as input modbam support use (chrom, pos, strand) as key instead of (chrom, pos) to handle CG mismatch in CCS read when call_freq v0.1.2 ---------- add pbmm2 as default aligner enable gzip output v0.1.1 ---------- bug fixes v0.1.0 ---------- initialize

نحوه نصب

نصب پکیج whl ccsmeth-0.3.2:

pip install ccsmeth-0.3.2.whl

نصب پکیج tar.gz ccsmeth-0.3.2:

pip install ccsmeth-0.3.2.tar.gz