معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

A package for inference and simulation of gene regulatory networks

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	cardamom-0.0.2
نام	cardamom
نسخه کتابخانه	0.0.2
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	-
ایمیل نویسنده	Elias Ventre <eliasventre@hotmail.fr>
آدرس صفحه اصلی	-
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/cardamom/
مجوز	-

# CARDAMOM CARDAMOM is an executable Gene Regulatory Network (GRN) inference method, adapted for timestamped scRNA-seq dataset. The algorithm consists in fitting the parameters of a mechanistic model of gene expression: the simulation of the model, once calibrated, allows to reproduce the dataset used for the inference. The method has been introduced in [1]. It has been benchmarked among other GRN inference tools and applied on a real dataset in [2]. [1] E. Ventre. “Reverse engineering of a mechanistic model of gene expression using metastability and temporal dynamics”. In: In Silico Biology 14 (2021), pp. 89–113. [2] E. Ventre, U. Herbach et al. "One model fits all: combining inference and simulation of gene regulatory networks". In: BioRxiv (2022).

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.7	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl cardamom-0.0.2:

pip install cardamom-0.0.2.whl

نصب پکیج tar.gz cardamom-0.0.2:

pip install cardamom-0.0.2.tar.gz